网格应用--天之痕

网格应用平台及其典型应用建设--生物信息学网格

该项目基于山东省高性能计算中心，建立一个可用于生物信息学相关计算、存贮及共享的应用网格平台。将校园网内的各种计算资源以有效的方式组织起来，隐藏其内部异构性和动态性，向网上生物信息学用户提供统一的透明网格服务。

具体研究内容包括：

（一）应用网格核心硬件环境的建立

基于山东大学校园网，将山东省高性能计算中心的IBM690（2000亿次）和浪潮机群（万亿次）、生命学院的SGI O2等机器作为网格的结点连接起来，构成山东大学应用网格的核心硬件环境，并能方便地与其它可利用的计算资源建立有效的连接。 

（二）应用软件、数据资源共享与开发

(1) 山东大学生物数据库的存贮与共享研究，用于数据库搜寻、序列比对、DNA片段拼装、进化分析以及蛋白质分析的软件包GCG Wisconsin Package的共享使用方式。

(2) 与香港城市大学合作进行计算生物学中相关算法研究，研制开发用于基因序列translocation距离、reversal距离的计算软件包。

（三）中间件软件的研制与开发

（1）应用网格的用户认证、授权系统

在一个开放、共享的网格环境中，完成用户的认证与授权系统，提供网格系统最基本的安全功能。

（2）应用网格计费系统

依据资源的使用任务的要求，提供应用网格用户使用资源的计费功能，作为对应用网格用户进行收费和服务质量保证的依据。

（3）应用网格服务访问方法

提供应用网格服务的访问方法，包括服务描述及服务请求等。

（四）应用网格门户的建立

建立应用网格门户，为用户提供简单的使用界面，并提供方便的网格资源使用模式、用户与网格资源的交互方式等，形成一种灵活的应用网格服务展现和访问方式。

提供与教育网格内同类应用网格接入的设备与相应软件。通过校园网格与中国教育科研计算机网用户共享计算资源。