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四川大学研究生最新论文获F1000推荐

 ironpan 2010-11-29
摘要: 来自四川大学生命科学学院的研究人员发表题为“Rapid and Accurate Detection of Plant miRNAs by Liquid Northern Hybridization”的论文,提出了一种利用液相Northern杂交来分析植物miRNAs的新方法,并分析了相应的条件优化。这一研究成果公 布在Int J Mol Sci.杂志上,并且获得了“Faculty of 1000 Biology ”(简称F1000)的推荐。

生物通报 道:来自四川大学生命科学学院的研究人员发表题为“Rapid and Accurate Detection of Plant miRNAs by Liquid Northern Hybridization”的论文,提出了一种利用液相Northern杂交来分析植物miRNAs的新方法,并分析了相应的条件优化。这一研究成果公 布在Int J Mol Sci.杂志上,并且获得了“Faculty of 1000 Biology ”(简称F1000)的推荐。


领导这一研究的是四川大学生科院博士生导师王胜华教授,文章的第一作者是其研究生王小粟,王胜华教授研究组主要研究方向是非编码RNA与植物生殖发育,植物发育的分子机理,植物与环境关系等。

 

F1000专家,西班牙植物生物技术与基因组研究中心的Julia Kehr点评这一文章:“这篇论文描述了一种称为liquid Northern hybridization(液相Northern杂交)的方法及其条件优化,此方法可用来快速检测并定量植物microRNA”。

microRNA (miRNA)是一组在进化上高度保守、非编码蛋白、参与转录后调节的小分子RNA。分析miRNA的加工机制及功能,定量研究miRNA的表达水平可以 采用Northern杂交的方法。Northern杂交是指将待测RNA样品经电泳分离后转移到固相支持物上,然后与标记的核酸探针进行固相液相杂交,用 以检测RNA的方法。但是这种方法费时较长,而且不一定能获得准确的结果。

在这篇文章中,研究人员将传统Northern杂交改进为液相Northern杂交,从而简便、准确、灵敏地杂交检测miRNA等小分子RNA,整个过程仅需几小时即可完成,还可以用于定量分析及在同一个实验中检测不同长度差异的小分子RNA。

这一方法的特点主要为:1. 相比传统的杂交检测方法,可以大大降低实验操作繁琐程度,缩短实验流程,减少实验耗费。2. 采用荧光标记的寡核苷酸探针,对实验人员造成的身体伤害少,污染小。3. 具有很好的检测特异性,可以区分1个碱基错配的microRNA,同时还可以采用不同颜色的荧光探针同时检测多个不同的microRNA。4. 可以对microRNA的表达做定量分析。因此,该方法可用于快速检测植物中各种小RNA,如miRNA及siRNA等。

“Faculty of 1000 Biology”创办于2002年1月,是一种在线科研评价系统,其推荐原则立足于论文本身的科学意义而非发表在什么杂志上。该系统根据全球2300多名 资深科学家的意见,提供对近期发表的生物科学论文的快速评论,目的是帮助广大科研人员遴选和发现有价值的研究工作。该机构专家根据论文对当前世界生物医学 和临床实践的贡献程度和科学价值,每年对全球SCI文章总数不足千分之二的优秀精品医学论文进行推荐和点评,并赋予“F1000论文”称号向医学界推荐, 涵盖了医学各个学科,是一项很高的学术荣誉。

生物通:万纹)

原文摘要:

Rapid and Accurate Detection of Plant miRNAs by Liquid Northern Hybridization

Northern blot analysis is a powerful research tool for discovery, validation and expression of genes, and is currently widely used to detect microRNA (miRNA) accumulation. However, the traditional Northern blot procedure, which is based on a support membrane, is overly elaborate and time-consuming, although it is unsurpassed in accuracy for determining the sizes and amounts of multiple small RNAs sharing high sequence identity. Here we present an alternative method derived from plant miRNAs, liquid Northern hybridization, using fluorescently labeled oligonucleotide probes and characterized by simple and specific miRNA determination and quantitation. The entire detection process is completed within a few hours, and multiple miRNAs can be simultaneously detected in a single experiment.

作者简介:

王胜华

简历:
2004.4-? 四川大学生命科学学院, 硕士生、博士生指导教师
1998.8-2001.4 武汉大学生物学博士后流动站研究人员
1993.9-1997.12 四川农业大学作物遗传育种专业博士生, 博士学位
1988.7-1993.8 贵州农学院,讲师
1985.9-1988.7 贵州农学院植物生理生化专业硕士研究生, 硕士学位
1979.-1982.7 江西农业大学农学专业, 学士学位

研究方向:
非编码RNA与植物生殖发育:植物生殖发育细胞内存在大量miRNA等非编码RNA;我们的研究兴趣是,探索这些非编码RNA与蛋白编码基因表达的关系及其在植物生殖发育过程中的作用与地位。
目前我们将传统Northern杂交改进为液相Northern杂交,从而简便、准确、灵敏地杂交检测miRNA等小分子RNA,整个过程仅需几小时即可完成,还可以用于定量分析及在同一个实验中检测不同长度差异的小分子RNA,论文获推荐为F1000论文。
植物发育的分子机理;植物与环境关系

研究内容:
西南资源植物的环境适应机理及其利用

从事科研项目:
水稻精细胞特异基因的功能与表达特性研究(2003-2005 国家自然科学基金委项目)
水稻花粉及精细胞特异表达基因功能的研究(2002-2004  四川省重点科技研究项目)
金沙江干热河谷地区麻疯树资源开发利用研究 (国家“十五”重点科技攻关课题)
中国西南地区抗旱植物资源研究(2003-05, 国际合作项目)
麻风树生物柴油共性关键技术研究(2007-2009)
中意国际合作项目“四川省麻风树生物柴油研发和产业化示范项目可行性研究”(2008, 科技部-意大利国土环境部)
麻疯树基因工程新品种创制技术的研究(2007-2010,国家“十一五”科技支撑计划课题)
miRNA与水稻雄胚子体发育关系研究(2011-2013,国家自然科学基金项目)

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