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BIOS与CMOS并不是相同的概念，BIOS是用来设置硬件的一组计算机程序（中断指令系统），该程序保存在主板上的一块只读EPROM或EEPROM芯片中，有时也将放置BIOS程序的芯片简称为BIOS。BIOS包括系统的重要例程以及设置系统参数的设置程序（BIOS Setup程序）。
CMOS则是计算机主板上的一块可读写的RAM芯片，用来保存当前系统的硬件配置及设置信息和用户对BIOS设置参数的设定，其内容可通过程序进行读写。CMOS芯片由系统电源和主板上的可充电电池供电，而且该种芯片的功耗非常低，即使系统断电，也可由主板上的备用电池供电，能维持其所保存的数据在几年内不会丢失。 由上面的解释可以看出，BIOS与CMOS既相关又有所不同：BIOS是计算机系统中断控制指令系统只读存储器；CMOS是计算机硬件系统的配置及设置可改写的存储器。BIOS中的系统设置程序是用来完成系统参数设置与修改的工具；CMOS RAM是设定系统参数的存放场所，是设置的结果。它们都和系统设置有密切的关系，因而也就有了笼统的BIOS设置和CMOS设置的说法。准确的说法应该是“通过BIOS设置程序对系统参数进行设置与修改，这些数据保存在CMOS中。”
总之，BIOS设置与CMOS设置都是简化和笼统的叫法，指的是一回事。但BIOS与CMOS是完全不同的两个概念，不可混淆。
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