农药名称是它的生物活性物质即有效成分的称谓、一般来说，一种农药的名称有化学名称、通用名称、商品名称和代号(一个或多个)。
1.化学名称
是按有效成分的化学结构，根据化学命名原则，定出化合物的名称。但是，化学名称专业性强，文字太长，特别是结构的复杂的化合物，其文字符号繁琐，使用很不方便。故除专业文章外资科普书籍中一般不常采用。但国外农药标签和使用说明书上经常列有化学名称。
2.通用名称
即农药品种简短的“学名”，是标准化机构规定的农药生物活性有效成分的名称，一般是将化学名称中取几个代表化合物生物活性部分的音节来组成，经国际标准化组织(简称ISO)制定并推荐使用，例如敌百虫的通用名称为trishlorfon，三环唑为tri-cylazole。通用名称第一个字母为英文小写。
各国的标准化机构或学术团体也可制定农药通用名称，例如敌百虫在前苏联称chlorofos，在土尔其为dipterex，英国为trichlophon，美国和加拿大为trichlorfon。由此在使用农药的外文名称时，应优先采用ISO的名称，若某农药的活性成分尚未有ISO的名称，而使用其他国家的名称时，应注明国别。
中国国家标准局1984年12月颁布了294种农药的通用名称(GB4839-84)，国家质量技术监督局1998年7月13日发布了经修订后的国家标准《农药通用名称》(GB4839-1998)中又新规定706个农药通用名称，合计1000个，它是在中国国内通用的农药中文通用名称，因此，在国内科研、教学、生产、商贸、出版物、广告等有关领域里，凡涉及到农药名称，都应该使用该标准规定的中文通用名称，其他中文名称应停止使用，以免混乱，例如三唑酮就不应再叫粉锈宁，氰戊聚酯就不应再叫杀灭菊酯、速灭杀丁等。
国家标准中相应列出的英文通用名称有921个，它是我国认可的国际化称谓，应该与中文通用名称平行使用。在进出口贸易、国际学术交流、出版物中需要使用农药外文通用名称时，必须使用该标准规定的英文拼写的通用名称。
3.商品名称
农药生产厂家为其产品在有关管理机构登记所用名称，用以满足商品流通是需要。英文商品名称的第一个字母应为大写，右上角注R。商品名称是受法律保护的，某厂生产的某个产品不能以另一厂同一品牌的商品名称上市，即使有效成分、含量、剂型完全相同，亦是如此，否则就是侵权。这样，同一种商品化的农药制剂出自不同厂家，就有不同的商品名称。有时同一厂家生产同一有效成分的农药制剂，因有效成分含量不同、用途不同、助剂成分不同或包装及规格不同，就可以有不同的商品名称。
国产农药产品，以往不允许厂家另取商品名称。同一种农药产品只有一个统一的以中文通用名称为核心的正式名称。它由三部分组成：有效成分重量百分含量-有效成分中文通用名称-加工剂型名称，例如80％敌敌畏乳油，不同厂家生产同一种农药制剂以注册商标相区别。原药名称的第三组成部分可以只写“原药”，也可按物态分别写为“原粉”、“原油”，例如87％辛硫磷原油，96％多效唑原粉等。对加填料或溶剂配成一定含量的原药，可按物态分别写成“母粉”、“母油”。现在国家允许厂家自取商品名称，农药生产者在申请办理农药登记时可以申请使用农药商品名称。农药商品名称的命名应当规范，不得描述性过强，不得有误导作用。农药商品名称经农业部批准后由申请人专用，但在商品名称的后面应以括号内写明有效成分的中文名称。
我国目前农药标签上和产品说明书上的农药商品名称的标注存在问题较多，主要是：不说明有效成分名称，不说明有效成分含量和不说明剂型，只要缺少其中任一项内容就会给使用者带来诸多不便。更有甚者，市售的个别农药产品，包装上仅有令人费解的名称，而有效成分的通用名称、含量和剂型都没有，文字说明上指出每亩(次)用1包或1瓶，这种做法不妥，也不科学，起码要说明1包或1瓶是多少重量，仅以每亩(次)用药量来说，全国各地在施用中也不完全相同。尤其是除草剂，东北地区和长江中下游地区的用药量有很大的差异。混合制剂的商品名称也存在不少问题，例如，北京市顺义农药厂的棉虫净，邯郸市太行农药厂的邯农一号和中国农科院植保所农药中试厂的中保1号，均为防止棉铃虫的三元混剂，在商品名称之后或之下均标明有三个有效成分通用名称的词头所组成的制剂，其通用名称为“辛•甲•高氯”。实际上棉虫净和邯农1号的有效成分为辛硫磷、甲基对硫磷和高效氯氰菊酯。因此，混剂农药标签应标明各有效成分通用名称的全称。
4.代号
在农药开发期间，为方便或保密所编的试验号码，为一组数字的名称。代号往往冠有表示研制单位或厂家的字样或字母，例如Bayer15922，NC-311，NP-55等。代号经常出现于研究论文和药效试验报告中。在农药商品化以后，就不应继续使用代号。
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