ENVI使用的是通用栅格数据格式，包含一个简单的二进制文件（a simle flat binary）和一个相关的ASCII（文本）的头文件。该文件允许ENVI使用几乎所有的影像文件，包括那些包含自身嵌入式头信息的影像文件。
通用栅格数据格式都会存储为二进制的字节流，通常它将以BSQ（按波段顺序：BSQ是最简单的存储格式，它将影像同一波段的数据逐行存储下来，再以相同的方式存储下一波段。如果要获取影像单个波谱波段的空间点（X，Y）的信息，那么采用BSQ方式存储是最佳的选择）
BSQ易于获取单波谱波段的单点信息。
BIP提供了最佳的波谱处理能力。BIP按顺序存储第一个像素的所有波段，接着是第二个像素的所有波段，然后是第三个像素的所有波段，以此类推，知道所有像素都存完为止。它为影像的波普维的存取提供了最佳的性能。
BIL是介于空间处理和波谱处理之间的一种存储格式，也是大多数ENVI处理操作中推荐的文件格式。它是先存储第一波段的第一行，接着是第二波段的第一行，然后是第三波段的第一行，直到所有波段都存储完为止。
头文件编辑：File--Edit ENVI Header.
多波段图像具有空间的位置和光谱的信息。多波段图像的数据格式根据在二维空间的像元配置中如何存贮各种波段的信息而分为以下几类
（1）BSQ格式（band sequential）
各波段的二维图像数据按波段顺序排列。
（（（像元号顺序），行号顺序），波段顺序）
（2）BIL格式（band interleaved by line）
对每一行中代表一个波段的光谱值进行排列，然后按波段顺序排列该行，最后对各行进行重复。
（（（像元号顺序），波段顺序），行号顺序）
（3）BIP格式（band interleaved by pixel）
在一行中，每个像元按光谱波段次序进行排列，然后对该行的全部像元进行这种波段次序排列，最后对各行进行重复。
（（波段次序，像元号顺序），行号顺序）
（4）行程编码格式（run-length encoding）
为了压缩数据，采用行程编码形式，属波段连续方式，即对每条扫描线仅存储亮度值以及该亮度值出现的次数，如一条扫描线上有60个亮度值为10的水体。它在计算机内以060010整数格式存储。其涵义为60个像元，每个像元的亮度值为10。计算机仅存60和10；这要比存储60个10的存储量少得多。但是对于仅有较少相似值的混杂数据，此法并不适宜。
（5）HDF格式
HDF格式是一种不必转换格式就可以在不同平台间传递的新型数据恪式，由美国国家高级计算应用中心(NCSA)研制，已经应用于MODIS、MISR等数据中。
HDF有6种主要数据类型：栅格图像数据、调色板(图像色谱)、科学数据集、HDF注释(信息说明数据)、Vdata(数据表)、Vgroup（相关数据组合)。HDF采用分层式数据管理结构，并通过所提供的“层体目录疗构”可以直接从嵌套的文件中获得各种信息。因此，打开一个HDF文件，在读取图像数据的同时可以方便的查取到其地理定位、轨道参数、图像属性、图像噪声等各种信息参数。
具体地讲，一个HDF文件包括一个头文件和一个或多个数据对象。一个数据对象是由一个数据描述符和一个数据元素组成。前者包含数据元素的类型、位置、尺度等信息；后者是实际的数据资抖。HDF这种数据组织方式可以实现HDF数据的自我描述。HDF用户可以通过应用界面来处理这些下同的数据集。例如一套8 bit图像数据集一般有3个数据对象——1个描述数据集成员、1个是图像数据本身、1个描述图像的尺寸大小。
在普通的彩色图像显示装置中，图像是分为R、G、B 3个波段显示的，这种按波段进行的处理最适合BSQ方式。而在最大似然比分类法中对每个像元进行的处理最适合BIP方式。BIL方式具有以上两种万式的中间特征。
在遥感数据中，除图像信息以外还附带有各种注记信息。这是提供数据结构在进行数据分发时，对存储方式用注记信息的形式来说明所提供的格式。以往曾使用多种格式，但从1982年左右起逐渐以世界标准格式的形式进行分发。因为这种格式是由Landsat Technical Working Group确定的，所以也叫LTWG格式。
世界标准格式具有超结构（super structure）的构造，在它的卷描述符、文件指针、文件说明符的3种记录中记有数据的记录方法。其图像数据部分为BSQ方式或BIL方式。
