我认为体系是空间，机制是流程，制度是规定。
体系：广义上的一个完整的大的系统。
机制：泛指一个复杂的工作系统(制度加方法或者制度化了的方法)
制度：要求大家共同遵守的办事规程或行动准则
机制这个词的含义多种,其基本含义主要的有四种,一是用机器制造的;二是机器的构造和工作原理;三是有机体的构造、功能和相互关系;四是泛指一个复杂的工作系统和某些自然现象的物理、化学规律。但行政机关公务文书中的机制的意思却是经常做某类事情的方式、方法。与前面四种含义接近但又不等同。简单说，机制就是制度加方法或者制度化了的方法。
那么,机制和方式或方法有什么不同呢?他们的区别主要有四点:
第一点，机制是经过实践检验证明有效的、较为固定的方法，作为一个组织的工作机制，不会因组织领导人的变动而随意变动，而单纯的工作方式、方法是可以根据个人主观随意改变的。
第二点，机制本身含有制度的因素，并且要求所有相关人员遵守，而单纯的工作方式、方法往往体现为个人做事的一种偏好或经验。例如监督机制，不仅指人人必须遵守的制度，而且应该包括各种监督的手段和方法。只有二者结合起才能发挥作用。
第三点，机制是在各种有效方式、方法的基础上总结和提炼的，而方式、方法往往只是做事的一种形式和思路。机制一定是经过实践检验有效的方式方法，并进行一定的加工，使之系统化、理论化，这样才能有效地指导实践。而单纯的工作方式和方法则因人而异，并不要求上升到理论高度。
第四，机制一般是依靠多种方式、方法起作用的，而方式、方法可以是单一起作用的。例如，建立起各种工作机制的同时，还应有相应的激励机制、动力机制和监督机制保证工作的落实、推动、纠错、评价等。建立完善的机制，才能使组织的建设稳步发展，保持长久的活力。
“机制”和“体制”的区别
“机制”指的是有机体的构造、功能和相互关系，泛指一个工作系统的组织或部分之间相互作用的过程和方式，如：市场机制、竞争机制、用人机制等。
“体制”指的是国家机关、企业、事业单位等的组织制度，如：学校体制、领导体制、政治体制等。
两个词的中心语和使用范围不一样，“机制”由有机体喻指一般事物，重在事物内部各部分的机理即相互关系，“体制”指的是有关组织形式的制度，限于上下之间有层级关系的国家机关、企事业单位。
制度最一般的含义是：要求大家共同遵守的办事规程或行动准则。许多情况下，制度也是某一领域的制度体系，如我们通常所说的政治制度、经济制度、法律制度和文化制度等。制度具有很强的强制性和约束力。
体系，就是指广义上的一个完整的大的系统，里面有可能包括一些小的系统，构成一个个具有某种功能的结构。就像人体有循环系统、呼吸系统等小系统构了一个完整的人体体系一样的道理。
体系与系统是一个意思，两种提法，在英文中都译为System。系统一词于古希腊语，是由部分构成整体的意思。生物学意义上的系统是指能完成一种或几种生理功能的多个器官构成的整体,所以我们又可以把系统称之为体系。中国传统医学的“经络说”就认为，人体是由12条经脉、365条脉络纵横交错形成的整体，“脏腑说”则把人体看成是由五脏(心、脾、肺、肾、肝)六腑(胆、胃、大肠、小肠、膀胱、三焦)构成的统一整体，他们各自的位置和功能不同又彼此联系，共同制约着人体的健康。系统的的社会学定义为：由若干要素以一定结构形式联结构成的具有某种功能的有机整体。系统之间不是相互孤立的，而是互相联系的.
