由于形成的原因不同，可以分成①先天性肝囊肿，②创伤性肝囊肿，③炎症性肝囊肿，④肿瘤性肝囊肿，⑤寄生虫性肝囊肿。平常我们见得最多的90%以上的囊肿就是先天性肝囊肿（也叫真性囊肿）。
创伤性肝囊肿是肝脏外伤后的血肿或组织坏死液化形成的一个囊腔，因为它不是一个真正的囊肿，所以也把它叫做假性囊肿。
炎症性肝囊肿是由胆管发炎或结石梗阻引起的胆管囊状扩张，内容物是胆汁，也叫胆汁潴留性囊肿。
肿瘤性囊肿包括畸胎瘤、囊状淋巴管瘤、囊腺瘤等。
寄生虫性囊肿主要是肝包虫性囊肿，病人在牧区接触犬、羊或直接食入棘球蚴绦虫卵后，虫卵在肠道孵化成幼虫进入血液停留肝脏生长发育成包虫成虫，并在肝脏内形成包虫生活的一个“窝”，这个“窝”就叫肝脏包虫囊肿。
肝脏先天性囊肿是一种胚胎发育障碍性疾病，所以说它是一种良性的、先天性的疾病。说它良性，是说它一不是肿瘤、二不是癌症、也很少癌变，它是肝脏里面的一个“小水球”，球壁是上皮细胞，球内是水，上皮细胞产生水，使水球不断膨胀变大。说它是先天性，是说它的正常细胞在胚胎期没有发育好，不是说它在胚胎或出生后就开始长囊肿，大多数都在身体不长或衰退性即成年或老年时开始长大。
先天性肝脏囊肿分为单发、多发及多囊肝。 囊肿的数量可多可少，少则一个，几个、十几个，多则成千上万个（多囊肝）。囊肿的大小可大可小，有些很小，只有几个毫米；有的黄豆大小，葡萄大小，鸡蛋大小；有的可大到20多厘米。囊内液体少则1毫升，多则可达上万毫升。多囊肝常常合并有多囊肾。
临床表现
疾病症状
当囊肿直径达10多厘米时可能会出现压迫症状，比如压迫胃、压迫肠出现上腹部饱胀感；压迫膈肌影响呼吸；肝门部的囊肿压迫胆管可出现黄疸；多囊肝压迫使正常肝组织越来越少，肝功能受到影响。如果囊肿内细菌入侵感染，可以出现腹痛与发热。
创伤性肝囊肿除了有外伤史外，可以有右上腹部疼痛，发热等。
炎症性肝囊肿常见的症状是反复发作的腹痛、发热、黄疸。
肿瘤性肝囊肿可以出现腹部膨隆、腹胀、消瘦等。
肝包虫性可以有过敏反应、腹痛、腹胀、腹部包快、肝大、发热、黄疸、腹水等。
疾病危害
先天性肝囊肿大多数因为很小对人体没有什么影响，对肝脏也没有影响，因此也没有什么症状，绝大部分都是在体检时发现。当囊肿越长越大、越长越多时就会出现症状。
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诊断鉴别
辅助检查
肝脏囊肿检查首选B超检查，既便宜简单又准确可靠。CT对肝囊肿的诊断意义很大：可以把整个肝脏显示在CT片上，然后肝脏上所有大大小小的囊肿都可以呈现在CT片上。这种图像的显示比我们平时看到的B超图像要全面、清楚，我们自己和临床医生可以更好地了解肝脏囊肿的情况。肝脏包虫性囊肿可以做包虫囊液皮内试验（Casoni试验），但禁止做诊断性穿刺，以免引起过敏性休克和包虫腹腔扩散。
鉴别诊断
肝脏囊肿除了要区分先天性、创伤性、炎症性、肿瘤性和寄生虫性外，还要与肝脏血管瘤、肝脓肿、肝癌等鉴别。鉴别的方法需要临床医生根据病史、症状、体征、化验和检查去综合判断。例如肝脏海绵状血管瘤增强CT时表现瘤内有血流、或血流由周边向中央弥散，而囊肿是没有血流的。肝癌病人常有乙肝、乙肝病毒携带、肝硬化，化验甲胎球蛋白升高，CT增强扫描呈现血流快进快出的表现等。
疾病治疗
创伤性肝囊肿如果没有感染或胆汁潴留，可以自行吸收。否则需要做穿刺引流或手术引流。
炎症性肝囊肿需要手术治疗原发病如胆管结石、胆道狭窄等。
肿瘤性肝囊肿常常需要手术进行切除。
肝包虫性囊肿需要手术治疗。
先天性肝囊肿绝大部分都不需要处理，只需要定期观察。一部分生长较快、囊肿较大、伴发感染、出现症状者需要处理。
先天性肝囊肿处理的原理很简单，就是把“水球”内的水引出来或让其不再产生水。包括①囊肿穿刺抽液术，②囊肿开窗术，③囊肿引流术，④囊肿切除术，⑤肝移植术。小一点的囊肿通过穿刺注入无水酒精、破坏囊肿上皮细胞，使其不再产生水，囊肿也就不会长大了。大的囊肿可通过微创手术（腹腔镜）在囊肿上开一个口子，让水引流至腹腔，水就可以吸收了。有些囊肿需要切除部分肝脏。
如果是多囊肝采取上述处理就比较困难了，当其影响了肝功能时，唯一的办法就是肝移植了。
先天性肝脏囊肿目前还没有预防办法。也不能通过药物治疗和预防。重要的是定期体检与复查。
