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!!!! Circos: 数据可视化圈图 工具 使用配置文件

 看见就非常 2012-11-30

2011-8-23更新:

1 circos qq交流群 171307056

2 新浪微博 http://weibo.com/circos 

3 腾讯微博 http://t.qq.com/circos 

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2011-6-9更新:

1 circos新域名   ;

2 circos文档翻译项目 http://code.google.com/p/circos-chn/

3 CIRCOS用户交流 豆瓣小组 http://www.douban.com/group/circos/ 

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Circos:  数据可视化 工具

适合级别:入门

关键字   :circos, 可视化, 数据可视化,infographics,viz

 

 

数据可视化,已经是有着很成熟的理论和方法了,尤其是在生产与工程中。 数据可视化技术也与it技术紧密相关。

 

本文中笔者将介绍一个用于数据可视化的典型程序包-circoshttp://mkweb./circos/ 

 

[CIRCOS网站有更新 --- 2010-1-23]

 

circos - visualizing the genome, among other things

Use Circos to create concise, explanatory, unique and print-ready visualizations of your data.

 

 

Circos

 

简要介绍:

  • Circos最初主要用于生物信息领域的基因组数据可视化,实际上它也很适合很多其他领域的表格数据等的可视化!如果感兴趣, 可以在它的官方网站了解更多的信息!http://mkweb./circos/
  • 它的作者也是数据可视化领域的专业人士,对于计算机相关的交叉学科有着独特的研习!

 

  • circos使用perl脚本语言实现,依赖诸多的第三方perl程序包;
  • 对于圈图,基本原理是使用极坐标的思想来定位图形元素,使用二次贝塞尔曲线来画圈内曲线,使用平面几何的知识来处理圈内的曲线关系。

 

ps:

1 笔者由于工作关系,对该程序也有一定程序的了解和使用经验,目前可以熟练使用以解决工作中的问题;有需要画图的朋友可以和我交流下!

 

2 此文自发布以来,收到了很多网友的求助信,很感谢大家对我的信任和对circos的关注;

 

3 总的来说,我的个人建议如下:

 

(1 如果你打算在自己的工作中使用circos,那么你需要一点perl语言基础和svg基础知识;同时,仔细学习circos网站教程的前5章,需要的话可以全学,并边学边练,和实际问题相结合,1到2两即可熟练使用。

 

(2 如果你只是用一两次,那我还是建议你求助别人吧;毕竟要熟练画出自己满意的circos圈图,还是需要点付出的。

 

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评论
2 楼 bluky999 2010-02-01  
另外声明: 转载本文要注明出处啊!!! 
1 楼 bluky999 2009-10-19  
此博文自登出以来,收到过一些感兴趣的朋友的咨询---关于circos的使用!

简单说,circos使用配置文件机制来指定输入、输出,以及配置输出图形的各种参数。

如果你打算使用circos,建议你花一些时间来学习其网站上的教程(共10章,一般只需按需学习其中的5章左右的内容即可); 如果你只想画一张图,以后几乎不会再用,所以不想画时间去学习其安装和使用;那么很遗憾,我的建议是你还是找个会画的人帮你画吧,不要太想当然和浪费时间!

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