最好同时设计几对,选择效果较好的,别忘了做对照(GFP),排除非特异性干预
1.不同的细胞及转染试剂对于质粒和脂质体的比例要求是不同的,所以在正式实验前必须摸索一个最佳转染比例。总的来说,细胞系较原代好转,脂质体的用量以说明书为参考上下浮动。 2.对于转染后的效应检测,体外直接合成的SiRNA多半在48h检测,也有72H的,但时间再长有可能降解而失去功效。对于用U6或H1质粒载体体内转录生成siRNA的,因为有一个转录时间,所以检测可以稍靠后;而且,与体外合成的相比,虽然载体也不能大量整合到细胞基因组中,但毕竟不会马上降解,Knockdown的时间效应相对要长,一般一周左右没有问题。所以可以在检测时做一个时间梯度,使实验数据更加丰满完善一些。(但要考虑靶细胞生长特性,疯长的可能效果较差)
一般在转染后4-6小时补加血清,可以就在你原来的无血清培养基中滴两滴血清。如果你觉得LF2000可能对你的细胞有毒性作用的话(一般LF2000的毒性不至于很大,可以不用更换培养基,具体看你细胞的生成状态了),你可以把原来的无血清培养基吸出来,更换成含血清的培养基。在转染后的4-6小时,最好不要动你的细胞,让它安静地躺着,因为此时细胞最为脆弱,不合适的动荡会使其死亡率增加。
lipofectamine2000转染后在6小时左右最好换液且换为有血清的血清,其一因为lipofectamine2000对细胞的毒性作用还是有的,其二可降低因血清的缺乏引起的细胞的死亡。转染时不加血清是防止血清的干扰作用,转染后可适时加入。加入过早会引起未转染细胞的优势生长,过晚会引起较多细胞死亡。可时时观察1/5细胞变圆的时候加入血清。
转染全程都不应加有抗生素的,我刚刚做完LP2000转染的,把我的一点经验告诉你啊: 1.加完脂质体DNA混合物后细胞就出现小黑点,这很正常的,因为LP2000即使毒性再小它也是有毒性的,减轻的办法就是4-5小时把混合物去掉换有血清的新培养基培养,我做之前看有些战友的意见毒性大3小时换也行的。 2.我的是在无血清的DMEM下转的,推荐买OPTI-MEM,但到货一个月,我也没用,不过还可以的 3.多摸几个浓度比例,找出最适合的,如果有报告基因就最好了,但是我的也没有。 4.细胞密度要够哇,80%左右吧,我感觉细胞死的还挺多的。 5.按照LP2000操作说明来做,基本上没问题的。 6.这个我应该建议你在做之前搜索本版,好好看看战友的经验,绝对受益匪浅啊
RT-PCR检测转染
提取RNA中混杂有少量质粒DNA会出现RT-PCR假阳性。 排除方法:设一阴性对照,用提取的RNA(不经RT)直接作模板进行PCR扩增。
我准备研究某基因功能,构建了重组表达质粒(以荧光素酶为报告).现准备转染细胞,并以不含目的基因的质粒作对照。请问: 1.如果以beta-gal质粒共转染作内参,荧光素酶活性如何校正? 2.如果以beta-gal质粒共转染作内参,各种条件转染需作复孔吗? 3.各种条件转染均作复孔,结果经统计学处理,目的是排除孔间转染效率差异。是否还需要作共转染内参照?
为了简便,大多数的研究者,如楼上所说,把LUCIFERASE的活性值除以beta-gal的值就行了。但理论上讲是应该将内源性的beta-Gal活性扣除的,对于哺乳细胞,内部是有此酶活性表达的。所以,要设一个孔,任何DNA都不转染,然后把所有的beta-gal活性值都减去这个阴性对照的数值,最后把这个值与LUCIFERASE的活性做比,求出的比值为LUCIFERASE基因前面PROMOTER的活性。 PROMEGA有一种试剂盒,做内参照的不用beta-gal,是另一种LUCIFERASE,用不同的底物。这种酶在细胞内没有内源性的表达,结果更可靠些。 这个beta-gal一定要加,因为它是衡量转染效率的。它可是告诉你,是十个DNA转进去了,还是一百个。如果没有这个衡量标准,转进去了一百个DNA的LUCI活性当然强,如果跟转进去十个的比高不了多少,那事实上LUCI前的PROMOTER活性还是低。如果没有这个标准就会得出错误的结论了。 减去背景beta-Gal的时候不可直接减,要换成(活性/毫克)再减,这样相当于每个细胞里减去背景。同样的道理,做比值的时候也要把A值换成(活性/毫克)再与beta-Gal比。 不知说明白了没有。总之感觉处理数据很困难。总体的趋势应该和两值直接比差别不大(在背景比较小的时候。有的细胞背景就是高)。
有两种可能,一是LIPO对你的细胞毒性大,解决方法是五小时转染完成后,把转染混合液吸出,再加培养液。二是该细胞对你转染进去的质粒表达产物敏感,或是被诱导了APOPTOSIS,或是造成了DIFFERENTIATION,解决方法是换一种细胞,看这种现象是否发生
MTT检测的是细胞的活性,即活细胞数的相对量,不可能用来检测转染效率.MTT检测最后细胞都碎裂,如何继续培养.可做三个平行孔,分别24.48 72小时检测. 想做Western和,RT-PCR和流式的话,如果这些孔转染相同的质粒,当然可从其中几个孔的细胞做Western,再取另外几个孔的细胞作 RT-PCR,再取别的孔的细胞作流式?其实瞬转质粒的效果都不好,建议还是做稳定表达.
可考虑以下原因: 1.培养基必须在转染24小时前换用无双抗的。 2.质粒虽然是按说明书提取的,但要看清楚质粒提取试剂盒是否可以去除内毒素。 3.如果选用Invitrogen Lipofectamine 2000,它提供的参考步骤并不一定是你选用的培养板规格,须参照后面的列表. 4.培养板非常容易污染,必须排除微生物污染的可能. 5.可以考虑转染5小时左右吸去转染液体,换用含血清的培养基继续培养. 6.转染前你培养了多少时间?如果进行顺式转染,必须在细胞生长达到70-80%再进行转染
个人认为你还可以考虑以下方面: 1.请确认你的Lipofectamine 2000是否已经过期,经过我们实验室的实践:尽量使用开封半年内的Lipofectamine 2000,因为过了半年后,就算没有过失效期,但是细胞毒性大大增加,而转染效率却大大下降。 2.确认你在使用Promega质粒提取试剂盒是使用了内毒素去除树脂(Endotoxin Removal Resin)。 3.按照Promega质粒提取试剂盒的protocol,在第19步加入nuclease-free water后直接放入-20或-80度冻存就可以,我们没有另外沉淀。 4.去除质粒提取中的酒精可以试用下面的方法:将Ep管倒置在灭菌的滤纸上,大概10-20分钟后就可以干了,注意不要时间过长,否则太干了,不太好溶解。 5.你可以尝试适当减低转染试剂的用量,并在转染5小时时观察细胞情况,并且换10%FBS的培养基,看看情况怎么样,因为转染液对细胞的损伤非常大。祝您实验成功!
各种培养细胞或细胞株对转染试剂的毒性敏感程度不一样, 脂质体的毒性大一些, 如果是转染试剂的问题,建议使用毒性低一些的转染试剂,如阳离子聚合物转染试剂,可以试试梭华-sofast。
http://www./newsf/2003-9/B2003917143939.htm 1.高质量的siRNA(或者是siRNA表达工具,比如质粒,PCR片断等) 2.有效的转染试剂。如何选择最适合的转染试剂和转染条件,往往取决于不同的哺乳动物细胞类型和不同的核酸分子。常见的转染试剂包括脂质体和多胺类的试剂,主要是为双链DNA转染而设计的。转染质粒DNA的最佳试剂往往不适合siRNA的转染,反之亦然。适合于质粒DNA转染用的转染试剂往往也不适合siRNA表达框(SECs: PCR fragments expressing siRNAs,参考RNAi:制备siRNAs的5种方法——如何选择最适合你的方法)的转染。随着RNAi技术越来越受重视,各厂家纷纷推出了自己的RNAi转染试剂。一:siRNA专用转染试剂 (二:质粒和PCR片断专用转染试剂)产品名:RNAiFect Transfection Reagent 厂家:Qiagen 优点:高效低毒;适用细胞广泛;即用型试剂,可在含有抗生素的完全培养基中转染,操作格外简单方便简介:siRNA的转染是基因沉默实验中关键的一步。RNAiFect是一种基于脂质的转染试剂,专门用于siRNA转染,确保没有RNAse活性。传统的转染试剂有一定的细胞毒性,在转染过程由于提高细胞的通透性因而不能在培养基中添加抗生素。由于RNAiFect的内毒素和细胞毒性都非常之低,加上转染复合物能够高效的在完全培养基中形成,因而整个转染过程可以在含血清而且是含有抗生素的培养基中操作,无需更换培养基,这极大的方便转染操作!该试剂可以耐受较高浓度的siRNA转染而不引起细胞毒性,能够得到更好的抑制效果,适用于包括AGS, HEK-293, HeLaS3, Huh-7, HUVEC, NIH-3T3, and mouse embryonic fibroblasts cells在内的多种真核细胞。操作流程: 1.用含有抗生素和血清的培养基,或者是附带的Buffer EC-R稀释siRNA 2.加入RNAiFect转染试剂,在室温下混合并孵育10—15分钟 3.加入培养细胞中即可。24—48小时后检测siRNA的干扰效果。 参考数据: HeLa-S3 cells were plated out in 24-well plates at a density of 6 x 104 cells in each well, 24 hours after transfection. Cells were transfected with lamin A/C siRNA using the transfection reagents indicated, according to the manufacturer’s protocol. mRNA was purified from the cells 48 hours after transfection and quantitative RT-PCR was performed using the QuantiTect SYBR Green RT-PCR Kit with primers targeted to lamin A/C and GAPDH. Expression of the lamin A/C gene was normalized to the expression of GAPDH and quantified using a standard curve prepared from known amounts of cDNA purified from HeLa-S3 cells. Cells were transfected and LDH activity in the cell culture supernatants was tested 48 hours later, using a colorimetric assay according to the manufacturer’s protocol. LDH activity in the cell culture supernatant of untransfected cells lysed by detergent was set to 100%. Background LDH activity was measured in untransfected and untreated cells, and this value was subtracted from all other measurements. Name Details Cat. No. 价格 RNAiFect Transfection Reagent, 1ml RNAiFect Reagent 1ml and bufferEC-R, for up to 170 transfections in 24-well plates; up to 500 transfections in 96-well plates 301605 2501 操作手册:RNAiFect Transfection Reagent 操作手册产品名:TransMessenger Transfection Reagent 厂家:Qiagen 优点:高效转染;RNA专用即用型试剂;简介:TransMessenger是第一个专门为转染RNA而设计的非脂质体的脂质型的转染试剂。没有RNase活性,内毒素≤10 EU/ml,经严格设计去除所有可能降低RNA转染效率的成分,确保高效转染。独特的缓冲液促进RNA聚集,经脂质体包装成为高效转染复合物。适用于包括293, BSC-1, MA104, MRC, Primary cortical and hippocampal cells, TRM-6 and TRM-6/PDX-1 cells, TU7D, Vero在内的多种细胞。操作流程:将RNA和Enhancer R,Buffer EC-R室温混合5分钟,加入TransMessenger Reagent室温孵育5—10分钟,加入培养基混合后加入细胞中,再温育培养3小时,更换培养基继续培养直到检测。操作手册 TransMessenger? Transfection Reagent Handbook (PDF version, 83 K