药理作用分，比如解热止痛按作用部位分，比如消化系统用药按医院科室分，比如妇科类用药最好按关联销售并结合自己情况分，比如感冒用药，止咳用药，儿童用药。。。
根据GSP（药品经营企业质量管理规范）的要求，药品经营企业的药品必须实行药品分类管理。而药店必须通过GSP认证才允许营业。按照GSP的规定，零售药店药品要求分类管理。一、药品在陈列时：1、首先药品与非药品要分开存列。（挂非药品区绿牌）2、处方药与非处方药要分开陈列。（挂处方药区绿牌和非处方药区绿牌）3、（在处方药与非处方药这两大块中再分）口服药与外用药要分开，注射剂要分开。以上药品分类陈列以后还要按剂型或用途分柜或分层存放。（各柜台用绿色及时贴标示如：抗菌消炎药、消化系统药、妇科用药、儿科用药、等等）4、易串味药要有专用柜台。（用绿色及时贴标明：易窜味柜）5、拆零药品要集中放于拆零专柜或抽屉。（用绿色及时贴标明拆零专柜）并保留原包装的标签。6、危险品不能陈列，必须陈列时应该用空包装。7、中药饮片装斗前应做质量复核，不得错斗、串斗、防止混药、饮片斗钱应写正名正字。（挂绿色牌：中药饮片区）8、需要冷藏或阴凉处储存的药品要陈放在2—10度的冰柜里。9、还要在一个比较隐蔽的角落设不合格药品柜。（贴红色不合格药品柜及时贴）。10、大型零售企业，验收一时半会验不完，应该设一处待验区，挂黄色牌。小型零售企业一般进货就验收完毕，一般不设待验区。二、在销售药品时：1、销售处方药必须凭执业医师或执业助理医师处方，处方必须由驻店执业药师审方后方可调配发药。2、消费者不愿意留下处方的，要做处方药登记2、非处方药不需要凭执业医师或执业助理医师处方，消费者可自行判断、购买和使用。一般药品分为：处方药、非处方药（甲类非处方药、乙类非处方药）按照功能与用途分01、抗生素类药品02、心脑血管用药03、消化系统用药04、呼吸系统用药05、泌尿系统用药06、血液系统用药07、五官科用药08、抗风湿类药品09、注射剂类药品10、糖尿病用药11、激素类药品12、皮肤科用药13、妇科用药14、抗肿瘤用药15、抗精神病药品16、清热解毒药品17、受体激动\阻断药和抗过敏药18、滋补类药品19、维生素、矿物质药品
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