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目前，我国专科医院建设的现状是：一是数量少且水平低，二是发展潜力巨大且势头迅猛。
长期以来，我国城市医院普遍存在着综合性医院多而不专、专科医院少而不精的问题。综合性医院一直是沿着“大而全”的方向发展，其特点是：科系多、样样有、门门松。这种统一“模式”下建设起来的“全能医院”严重束缚了专科技术的发展。依靠这种布局，用以解决常见病尚可，但是面对医学科学日新月异的发展，一个医院的一个专科的发展靠如此薄弱的人力、物力是很难有作为的。
随着医学科学的发展，临床分科越来越细。这种实际需要和客观可能之间的矛盾已经越来越突出，一些科系逐渐分离出来，发展成为独立的专科医院。精细分科是医学进步的标志，卫生行政部门和医院管理人员有责任为这种分化和飞跃积极创造条件。
除少数大城市，我国专科医院建设发展的速度不快，最早的专科医院只限于传染、结核、精神三种，后来才陆续有了儿童、妇产、口腔、耳鼻喉、眼科、肿瘤、脑科、职业病等专科医院。在这些专科医院中，只有少数医院在发展专科技术、培养专科人才、进行科学研究等方面成为省内、市内或全国的龙头医院或技术中心，多数专科医院仍然规模小、骨干少、设备差、水平低，与综合性医院同类专科相比，还不具备竞争优势。
在发达国家，城市的专科医院数目远远超过综合性医院（社区医疗除外）。近几年来，随着我国医疗卫生体制改革的不断深化，一些中小医院关停并转。其中，部分医院由综合性医院改为专科医院，使专科医院的数量猛增。由于专科医院在资金和设备投入上相对较小，容易在医疗市场的夹缝中生存甚至脱颖而出，故专科医院越来越多，规模越来越大，档次也越来越高。估计这一势头还会持续，专科医院的兴建数量有可能超过综合性医院。作为卫生行政主管部门，应该有计划、有步骤、有目的地做好宏观调控工作，把现有的部分城市综合医院逐步改造成专科医院，同时重点培植综合性医院里的重点专科，使它们成为本地区同类专科的技术中心。
需要特别指出的是，专科医院的建设受社会因素和疾病谱及其顺位的影响较大。前几年，出于传染病院、结核和肺科医院等专科医院被严重削弱，以致在遇到突如其来的非典型肺炎流行时，各级政府和各级各类医院都措手不及，各方面损失巨大。这一教训是极为深刻的。
如何把握此类专科医院的建设和发展是一个值得探讨的重大课题。一方面，随着预防医学的发展、社会预防工作的加强、人民生活水平和健康水平的提高、各种传染病有的被控制有的被消灭，传染病院的任务量客观上大大减少。当结核病的发病率像某些国家那样已下降到万分之零点几的时候，结核病院的确正在逐渐失去它存在的价值。另一方面，新的传染病又在不断的出现，老的传染病在特殊条件下有可能卷土重来。因此，正确的策略应是：保持少而精的疾控队伍，储备一定数量的后备队伍，同时制度上创新，措施上完备。一旦出现紧急公共卫生问题，则招之即来，来之能战，战之能胜。对其他专科医院，政府在及时而准确地做出科学预测和指导性意见的同时，要充分发挥市场的调节作用，让市场决定该上的上，该撤的撤，该转的转。
专科医院的特征就是“专”，专科医院的生命力也在于“专”。专科医院就是要专科专治，专病专治，分工细，专业化程度高。突出的专科优势和专家优势是专科医院的核心竞争力所在。
专科医院的建设应该逐步实现以下目标要求：
第一，服务半径要大。
办医院，要计划、规划并要经常分析和策划自己的服务半径问题。中小型综合性医院应盯住社区，大型综合性医院和专科医院应尽量扩大自己的服务半径。专科医院的专科优势一旦形成，就会形成较大的服务半径。因为，“酒香不怕巷子深”。
第二，技术水平要高。
专科医院的重要功能之一就是解决一般综合性医院解决不了的专科问题，所以专科医院的诊疗水准一定要高，专业技术骨干一定要出色甚至拔尖，学科带头人最好是本学科或分支学科的技术权威。
第三，医疗设备要精良。
专科医院一定要有较高的设备档次，尤其是要确保专科设备的先进性。这是参与激烈的医疗市场竞争的必备条件。
第四，专业分工要细。
要想实现专科医院的“高”、“精”、“专”，必须强调明细分工。只有这样才能在技术上“精益求精”。专科医院要根据本学科的发展走势和分支情况建立专业组和二级分科，床位分设，人员固定，使专业技术人员真正做到技术专长突出甚至“身怀绝技”，成为一个方面的专家。
第五，要加强科学研究。
专科医院应该加强基础医学和临床实验研究，建立必要的实验室、研究室。目前，多数专科医院基础医学理论研究工作相当薄弱，临床医学研究仍处于临床观察和病例分析的感性认识阶段，不能系统地探索疾病本质。这一现状应逐步改变。专科医院应利用自己的优势，兼顾科研工作，力争多出成果。
第六，要有一定的教学设施。
上规模、高层次的专科医院应承担高等医药院校的教学任务，并负有培养在职专科人才的任务，有条件的还要招收研究生。所以，医院内应有电教室、图书资料室等必要的教学设施，以使现代化的专科医院成为教学和培养人的重点基地。
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