欢迎关注“实习医学生”微信公众平台! 医学信息检索知识点梳理 目录 1.绪论 2.中文数据库检索 3.PubMed检索 4.Web of Science检索 5.NoteExpress文件管理软件 6.学位论文检索 7.电子书检索 8.google网络搜索 9.检索策略 绪论 1.检索基本思路:(例:2010年甲流发病率) ①准确了解背景知识(甲流,甲型h1n1,权威机构,权威作者) ②挖掘隐含的信息线索(卫生部,统计数据) ③切分为多个词语输入(2010 h1n1 发病率) ④选用核心词,省略不重要的词(甲型)
2.文献类型: ①图书:教科书、工具书、专著 ②连续出版物:期刊、报纸 ③特种文献:标准规范、会议文献、产品资料、专利文献、科技报告、学位论文 【会议文献(conference、proceeding):比期刊信息更新,但全文较难获取】 【学位论文 (dissertation ):篇幅长、论述循序渐进,实验方法表达详尽】
3.不同文献类型的用途: ①概念、定义、背景知识查找:百科全书、词典、辞海、专著 ②事件、数值查找:年鉴、报纸、统计资料等数值数据库 ③课题研究内容:期刊、会议文献、学位论文、科技报告 ④技术研发、申请专利:专利文献、成果数据库
4.文献的加工深度: ①一次文献(原始文献) ②二次文献 (目录类文献、索引) ③三次文献(教科书、参考工具书、综述) ④零次文献(私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等)
5.违规行为: ①超过正常阅读速度,连续、系统、批量地进行下载。比如在一小时内下载超过百篇以上的全文文献、对某本期刊整本或整期下载。 ②使用软件、工具批量下载电子资源,如“网络蚂蚁”或“Flashget”之类网络机器人软件。
6.查准与查全: ①了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断的信息,以解决研究中的具体问题,要求以“准”为主 ②申请发明、申报成果奖励、鉴定科研成果以及立项查新时,往往需要全面地收集某一主题范围的文献信息,这类课题具有普查追溯的特点,应着眼于“全”
7.常用英文数据库: ①PubMed(北美期刊为主,文摘, 全) ②Web of Science 核心合集(文摘,精) ③Embase (欧洲期刊)
8.常用中文数据库: ①中国学术期刊网络出版总库(即中国知网)(全文) ②万方数据—期刊、会议、学位论文等(全文) ③中文科技期刊数据库(维普,全文) ④中国生物医学文献数据库(即CBM)(文摘) ⑤超星电子书(全文) ⑥西医图书数据库(人民卫生出版社)
9.检索途径:
推荐:分类搜索+检索词
10.逻辑算符: ①逻辑算符(布尔算符):与(交集)、或(并集)、非 【运算次序:一般为:not →and →or】 【在一个检索式中同时出现and, or时,如果要先算or的部分,应把or的部分输在前面,或输在一个检索框内。如果在专家检索中输入检索式,应用括号括起or的部分】 ②精确匹配符(短语匹配):“” ③位置算符(邻近算符):用于限定检索词之间的间隔单词数,有adj, near, N, W等 【tongue w/2 base表示两个检索词中间最多允许插2个词,词序可互换】 ④字段限定符 ⑤截词符与通配符: *词尾,替代0个或任意多个字符 , $,#等用于词中、词尾,一个通配符替代一个或0个字符
11.寻找中外文核心期刊: ①科技部中国科技期刊引证报告:http://coreej./,查询中文期刊影响因子、收藏图书馆 ②北大中文核心期刊要目总览:http://coreej./,查询“核心期刊”、本专业重要期刊 ③外文:JCR,在“Web of Science”的左上角
中文数据库 1.检索策略: 核心概念舌根肿瘤限定篇名(以确保查准) 次要检索词治疗可限主题或文摘 例:舌根肿瘤的治疗——中国知网 “舌根肿瘤”限定在篇名,而“治疗”限定在主题、文摘 使用“模糊查询”以查全同义词 “舌根肿瘤”可同义为舌根癌、舌根瘤,“治疗”可同义为手术、切除、疗法 还有“结果中检索” 因此可先检索“舌根肿瘤”,再检索“治疗” “分类检索”结合“主题检索”
2.中国知网搜索后: ①可分组浏览,确定核心著者群 ②导出题录:选择文献,点击导出 ③选中文献,点击阅读,批量预览全文 ④查看检索式 ⑤分析→文献互引图
3.CBM ①运算次序:NOT>AND>OR ②每个框只能输入单个检索词,不允许输入逻辑算符,多个字段组配需分步发送到检索框 ③主题词表来自中国中医研究院图书情报研究所新版《中医药学主题词表》 【可通过CBM查询规范的英文主题词名,再去PubMed上面查】 ④主题词检索的功能: 将非主题词引见到主题词形式 提供主题词的定义、注释 显示主题词之间的族性关系(上位词、下位词、同位词) 主题索引中提供中、英文两种形式 带*的主题词是重点论述的内容 ⑤副主题词:限定规范主题词某一方面研究内容的规范词,例: 诊断:诊断,放射摄影术,放射性核素成像,超声诊断等 治疗: 治疗,药物治疗,放射治疗,外科学,膳食疗法,康复,中医治疗等 病因: 病因学, 病理学, 化学诱导,中医病机等 ⑥人工标引速度慢,最新论文未标规范主题词;新词、一些很专指的概念没有对应的主题词 (如舌根癌),因此CBM查文献应同时使用自由词检索以防漏检 先用“主题检索”搜索,再用自由词检索 最后合并两次搜索结果(组合检索式:(#1 or #2)) ⑦加权检索:相关性更强 扩展检索:含这个主题词的“下位词”(更细分类)。若不扩展,就排除了这个主题词的下位词里的内容,只剩归不进下位词的内容
4.维普: 每个框均可输入检索式*、+、-
5.三个中文数据库比较:
5.中文综述检索: 搜“综述”“概述”“进展”“现状”“展望”“回顾” 综述可短时间内了解研究的最新动态、研究分支、确定选题方向、提高研究起点 【英文综述直接在结果中选择Review即可】
PubMed 1.特点:提供检索词智能转换匹配,仅含期刊文献,不含学位论文
2.不同标引的含义: ①[PubMed-indexedfor MEDLINE]:来自MEDLINE,有MeSH字段和摘要的已标引数据 ②[PubMed-OLDMEDLINEfor Pre1966]:来自MEDLINE,无MeSH字段和摘要的1949-1965年间的数据 ③[PubMed-inprocess]:来自MEDLINE,尚未经MeSH字段标引的处理中数据 ④[PubMed-assupplied by publisher]:非MEDLINE,无MeSH字段标引,直接由出版商提供 ⑤[PubMed]:非MEDLINE,无MeSH字段标引
3.检索规则: ①每个框可输入多个检索词,运算符必须大写 ②系统默认空格为AND检索,但有字段限定时不拆分 ③著者检索[au]:姓全称在前,名首字母在后 ④刊名检索[so]:全称或标准缩写 ⑤查文章作者全名:[FAU] ⑥PubMed可智能转换匹配,具体匹配语句详见右侧下方的Search Detail 例:livercancer →'liver neoplasms'[MeSH Terms] OR ('liver'[AllFields] AND 'neoplasms'[All Fields]) OR 'liverneoplasms'[All Fields] OR ('liver'[All Fields] AND'cancer'[All Fields]) OR 'liver cancer'[All Fields] ⑦左侧可进一步在结果中筛选
⑧凡是标题带[]的,就不是英文文献!下面会告诉语种 ⑨检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。可组配检索式,如:#1 OR #2,#1 AND child
4.字段含义说明
5.MeSH词表查规范词 选“MeSH”数据库,而不是“PubMed” 例:在“MeSH”里查“liver cancer”,点进去,出现“上位词”“下位词”“款目词(不规范词)” 主题词检索后应补查最新一年的未整理主题词的文献,再用检索历史合并检索结果 查找杂志规范名:选“NLMcatalog”数据库,而不是“PubMed”
6.检索结果导出: Send to→MEDLINE→txt【导出后可直接导入题录到NoteExpress】 Send to→summary→csv【导出后可用excel打开,然后复制标题到谷歌翻译,快速浏览搜索结果】
7.PMC (PubMed Central) 生命科学免费期刊资源中心 免费提供900多种期刊的10多万篇全文 其中部分文献被PubMed涵盖
8.分析PubMed结果: 德国网站GoPubMed:www.goPubMed.com 可提供时间、国家、城市、刊物分析
Web of Science 1.检索范围:期刊、技术专利、会议录、化学反应、Internet资源、文献分析工具,不含学术论文 “更多设置”:勾选第一个、第四个即可,其他的与医学无关
2.其他功能:(页面最上方) ①JournalCitation Reports(JCR)(期刊引用报告数据库):与科学计量学工具结合,有分析功能 ②EssentialScience Indicators(基本科学指标数据库):提供了对科学家、机构、国家/地区和期刊进行排序的数据;依据期刊文章出版数量和引文数据,探索科学绩效统计和科学趋向数据;确定特定研究领域的研究成果和影响;评估潜在的雇员、合作者、评审人和同行 ③InCites(基于引文的综合性科研评估工具):评估数据来源于高质量的Web of Science引文数据库各学科领域30年的数据;从宏观的国家、机构、领域分析到微观的每篇论文、每个科研人员的绩效评估
3.检索方式:-
4.检索规则: ①在检索框中输入检索词(关键词、著者姓名、刊名等)。词组检索可使用双引号 ②支持AND、OR、NOT的逻辑组配,同时使用时遵循NOT>AND>OR的运算顺序 ③提供NEAR/X位置算符,表示由该运算符连接的检索词之间相隔指定数量的单词 (X为最大单词数);提供SAME位置算符,表示检索词出现在同一个地址中 ④著者检索输入格式为:SmithJP ⑤通配符:可用于词前、词中或词尾,* 替代多个字符; ?替代1个字符;$替代0个或1个字符 ⑥检索后再左侧“精炼检索结果”,可继续选择(类似PubMed左边,但可选性更高) ⑦获取全文:“出版商处的全文”、“S-F-X”(校园网可获得的) ⑧左下角“分析检索结果” ⑨CitedReferences越查越旧,Times Cited越查越新,RelatedRecords越查越深
5.检索字段选择: ①主题——包括标题、摘要、关键词字段TS=Topic ②标题TI=Title ③作者——作者、书籍作者、书籍团体作者、团体作者AU=Author ④团体作者——机构作者、书籍团体作者GP=Group Author ⑤出版物名称——期刊标题、书籍标题、丛书标题等SO=Source ⑥出版年PY ⑦著者所在机构地址(缩写)AD=Address;SA=Street Address;CI=City;PS=Province/State;CU=Country ⑧原文语种 ⑨文献类型 ⑩会议——会议标题、会议地点、会议日期、会议发起人 例:TI=(constipation) AND TS=(microflora ORmicrobiota OR microbiome) AND PY=(2013-2013)
6.检索结果导出: ①把搜索结果“保存至Endnote”,会保存为一个ciw格式的文件 ②NoteExpress导入题录,当前过滤器选“Web of Science”,文件格式不支持?选“任意文件”。这样就可以导入了
7.影响因子: 影响因子=该刊前两年发表论文在当年被引用的总次数÷某刊前两年发表的论文总数
NoteExpress 1.文献管理软件: ①NoteExpress:快速收集、有序存储、建立可检索的个人文献库;题录关联全文,随读随记;多角度归类、分析、筛选文献;随写随引,自动调整格式顺序 ②EndNote:只有网络版,全文不能附在题录后,无法进行笔记管理,不能添加标签 ③医学文献王
2.下载地址: http://www.library.fudan.edu.cn→常用数据库→ http://www.library.fudan.edu.cn/main/info/3242.htm(选教育网镜像比较快)
3.使用方法: ①文件→新建数据库→“题录”右键→添加文件夹 ·题录:文献的篇名、作者、关键词等简要信息 ·笔记:用户对每篇文献所作的摘记,感想等 ·检索:用户所有的检索指令 ·组织:文献按作者、机构、关键词等建立索引 ②题录的导入: ·批量导入题录:先在数据库中检索(如中国知网/PubMed)→(把所有的文章全选/一个一个选)→导出/Send to→以NoteExpress/Medline的格式保存 ·在浏览器中检索:包括CNKI,维普,ProQuest,PubMed,SciDirect(Elsevier),springer等数据库→点击Ne标签来添加到题录【缺点:浏览器中没有Ne标签的文章不能导入】 ·在线检索:先显示50条,逐渐再扩展,适合单篇文献查找,不适合大批量 ·手工录入:新建题录的关键词、作者等如果不止一个,用回车键分隔
③题录与全文或其他文件关联: ·待关联题录右键→添加附件 ·导入全文→待关联题录右键→在线更新→自动更新→选择在线数据库→查找更新→应用更新 ·导入全文之后,软件会自动抽取标题(文件名乱七八糟都无所谓),但非pdf的文件(如中国知网的caj)需要手动把文件名改成文章标题 ④下载全文:待下载题录右键→下载全文→选择全文数据库 ⑤题录可标注“优先级”、设置标签、移动复制到其他文件夹(自动关联,统一修改)、查重(检索→查找重复题录)、多角度归类(左边“组织”里查找)、统计分析(文件夹右键→文件夹信息统计) ⑥表头的修改:鼠标至表头处右键→自定义,可调整表头内容、顺序 ⑦笔记:可关联多个题录,一个题录可有多个笔记 ⑧插入网页信息:在IE浏览器里面,右键→add URL to NoteExpress(先安装IE插件)
4.随写随引: 安装word插件:在NE中点“工具”→选项→扩展 ①Word自动集成进去,点击“插入笔记”把笔记内容插入(不如复制再粘贴方便) ②点击“插入引文”或“检索”的方式生成引文 ③“格式化”变成想要的格式,如GBT_7714-2005,也可以按杂志社的要求自定义样式(工具→样式→样式管理器→双击“编辑选中的样式”→左边“题录-模板”可修改字体斜体等) ④插入脚注:样式编辑器中点击左边“注释”→右边“生成注释列表” ⑤文章或题录改动后,点“同步”来更新 ⑥“去除格式化”要点“清除域代码”,这样可以去除参考文献与引文的关联,但不能再同步
学位论文检索 1.ProQuestDissertations & Theses(PQDT): ①美国ProQuest公司出版的欧美博硕士学位论文库,收录欧美1000余所大学的160多万篇学位论文,是目前广泛使用的学位论文数据库 ②收录年代长,从1861年开始;更新快,每周更新; ③1997年以来的部分论文不但能看到文摘索引信息,还可以看到前24页的论文原文 ④国内三个镜像站有全文(北大、交大、中信所) ⑤http://search./dissertations/index?accountid=10025
2.检索规则: ①逻辑算符:and (与)、or (或)、 not(非) ②截词符:? 替代一个字符,* 替代任意个字符 ③词组短语:“”精确匹配 ④字段限定的格式:字段代码(检索词)例: ti(nanocarrier) AB(文摘) ADV(导师) AU(作者) DG(授予学位) LA(语种) TI(标题) SCH(学校) SU(主题) YR(年份)
3.检索结果导出: 导出为RIS格式,保存,在NoteExpress中导入题录时,选择RefMan(RIS)过滤器
4.中国大学学术论文:可通过万方或中国知网查找
电子书检索 1.常用数据库: ①读秀知识库 ②超星数字图书馆 ③CALIS中国高校教学参考书全文数据库 ④方正阿帕比电子图书 ⑤方正阿帕比工具书库 ⑥MyiLibrary 电子书 ⑦EBSCOe-book 电子书 ⑧Springerlink电子书 ⑨OVID电子书
2.可检索内容: ①寻找课题专业相关的图书:图书搜索(主题词,书名,分类浏览) ②寻找某本特定的图书:图书搜索(书名,作者) ③寻找原理、技术细节、方法等知识:图书搜索:目次(章节名)、全部字段搜索 ④寻找概念定义、具体事件等知识点:知识搜索(全文)
Google搜索 1.检索规则: ①必须检索:无需and,两词间空格默认and匹配 ②或者检索:OR必须大写 ③排除检索:用-表示,但减号前必须留一空格 ④短语检索:“”精确匹配 ⑤对大小写不敏感 ⑥检索位置限定: ·标题:allintitle ·网址:allinurl ·内文:allintext ·链接:allinanchor 例1:allinurl:nih搜索网址内含单词nih的网页 例2:查找2010年我国卫生部发布有关甲流的发病数,仅在moh.gov.cn(中华人民共和国卫生部网站)中搜索) ⑦文件类型限定:filetype:文件名后缀 支持13种非HTML文件的搜索:pdf,doc,rtf,ppt,xls,swf,ps等 例:'nanocircuits' evaluation filetype:pdf ⑧禁用词:最常用的字符以及数字和单个字母等高频词,在检索时系统自动忽略不作检索。如果必须检索禁用词时可用“”,包括:of,is,by,i,的,为,http,.com,3等 例:“worldwari” ⑨高级检索:搜索框旁边的▽ 优点:网页全文搜索,对于细小、专指度高的,文献较少的知识点查找较有效(指标、参数、表格等)
2.网站与网页: ①网页:浏览器显示的一个页面 ②网站:一个机构/个人在网上提供浏览或服务的站点,一个网站包括多个页面/网页 搜索某一网站的内容:site:…… 例:2010 甲型h1n1流感 发病数 site:moh.gov.cn
3.查找本专业网站: ①查找类似网站(Google) 例:查找与美国国立卫生研究院类似的网站,输入related:www.nih.gov ②查找链接网站(Google) 例:查找含美国国立卫生研究院链接的网站,输入link:www.nih.gov ③查找相关网站(ODP目录查询):www.dmoz.com
4.搜索引擎与目录网站的比较: ①搜索引擎:目标明确、主题较狭窄、知识点、事实数据、文献、新闻等网页查找 ②分类目录检索:目标模糊、主题较宽泛、查某专业重要网站
5.免费电子期刊查询: ①Free Medical Journals http://www. ②Directory of Open Access Journals http://www. ③HighWire Press http://www. ④学术机构网站 例:美国微生物协会(ASM http://www.),提供12种协会免费电子期刊浏览
检索策略 1.查准与查全: ①查准适用范围:了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断信息,以解决研究中的具体问题 ②查准率:检出相关文献数量÷检出文献总数,可计算 ③查全适用范围:立项查新、撰写综述、申请发明、申报成果以及鉴定科研成果时,需要全面地收集某主题范围的文献以鉴定其新颖性,具有普查追溯的特点 ④查全率:检出相关文献数量÷数据库中全部相关文献数,检索者难以计算 2.提高查准率的方法: ①仅在数据库的某个或某几个子集中检索 ②将检索词限定到标题、关键词字段 ③变and为邻近算符:near, adj…,或副主题词 例:asthma and therapy 改为asthmaadj9 therapy (OVID)、asthma/therapy (PubMed) ④使用精确运算符' ',精确匹配 ⑤限定主要主题词:加权(CBM)/restrictto major subject headings(PubMed) 3.提高查全率的方法: ①通过涵盖词形变化: ·查全单词的不同拼写方式,例:fibre OR fiber ·查全缩写与全称,例:MRI OR Magnetic Resonance Imaging ·使用截词符,例:transplant* ·查全错别字,例:肾综合征出血热 OR 肾综合症出血热 ·查全所有格形式,例:tongue adj2 base(OVID)、tongue near/2 base (Web of Science) ②通过查全子概念: ·用OR连接子概念,例:pulmonaryblastoma OR pleuropulmonary blastoma ·变词组检索为邻近检索,例:acute pancreatitis改为acute NEAR/2 pancreatitis ·变邻近检索为AND检索 ③通过改用上位概念检索词: 例:干扰素α-1b 改用 干扰素α ④通过调整检索字段: 相关度:篇名>关键词>主题词>摘要>全文 ⑤通过查全数据库:多库、跨库、跨类 4.如何平衡查准率和查全率 ①使用MeSH词表选词检索(若没有对应MeSH词的概念,使用上级概念对应的MeSH词),再结合自由词 ②核心概念、前提概念限定篇名、关键词;次要概念、集合概念限定主题、文摘 例:篇名=脓毒症 AND 主题=治疗 欢迎关注“实习医学生”微信公众平台! |
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