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功能性消化不良的主要症状是上腹部疼痛、上腹部烧灼感、餐后饱胀或早饱。 消化不良是指一组常见的症状包括上腹疼痛或不适（包括上腹饱胀、早饱、烧灼感、嗳气、恶心呕吐以及难以描述的上腹部不适感等）。 根据消化不良症状的病因，将消化不良分为器质性消化不良和功能性消化不良。未经调查的消化不良是指有消化不良症状的主诉，但未经过内镜等检查的患者。已调查的消化不良指已经接受过内镜检查。如排除了消化性溃疡、反流性食管炎、上消化道肿瘤等器质性疾病，称为非溃疡性消化不良，也就是被认为没有器质性疾病可以解释其消化不良症状的“功能性消化不良。 影响胃肠道功能诱发功能性消化不良症状的日常生活因素通常包括三个方面：一是心理和精神的不良应激；二是不良饮食习惯，包括刺激性食物（咖啡、浓茶、甜食、油腻、生冷等）和不良饮食习惯（包括空腹、频繁食用刺激性食物，以及不规律进食或暴食暴饮等）；三是环境温度的影响。 因为缺乏器质性疾病基础，功能性消化不良给患者带来的危害集中表现在上消化道症状引发的不适以及可能对生活质量的影响。部分患者因为功能性消化不良症状致进食减少、消化吸收效率降低，导致不同程度的营养不良（包括营养成分不全面）。 临床工作中，相当部分的功能性消化不良患者由于对疾病的认识偏差，心理负担较重，成为功能性消化不良影响患者生活质量的重要原因。
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