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进化论的几个缺陷
19世纪中叶，达尔文首次对“我们从哪里来？”这一问题进行了有科学依据的解释，“物竞天择，适者生存”作为达尔文进化论的核心思想，一直被教科书视为进化的根本原因。然而对于达尔文的进化论还存在很多争议，其本身也存在一定的缺陷。对达尔文进化论及创造论的解读及深入研究对人们解决自身人类起源至关重要。
虽然现今许多科学实验已经为进化论提供了论据，但进化论最初提出也仅仅作为一种假说，至今为止也没有证据证明该假说的正确，同时该理论所不能解释的问题也存有较多。
达尔文学说的核心是选择，然而这一核心并没有解决生物进化的动力问题，也就是遗传特性如何发生变异和形成物种的问题。从基因水平上看，基因发生突变是随机的，事实上，大部分突变对基因编码的蛋白质并没有影响，或者即使基因的改变使其所编码的蛋白质发生了改变也不一定对其功能产生影响，表型并不发生改变，也就是说基因的突变一般为中性突变，并不会经受自然的选择压力。这使得量变到质变的积累变得相当困难，也就因而无法解释寒武纪时期生物种类的大爆炸。
过渡态的化石从未被发掘是困扰进化论者的又一大谜题。“间断平衡”理论认为新物种的形成都是从一个大种群分离出的小种群，由于生活环境及面临的自然压力，及生殖隔离快速产生的，虽然确实有实验数据证明玛雅种群能在仅仅一代的时间内产生巨大的变异，也就是说在相对久远的地质年代中过渡态类型形成化石的几率极小，即使形成也很难发现，但仍不能排除过渡态类型化石的存在。同时，“间断平衡”理论与对经典的进化论相矛盾，达尔文认为新物种的形成是一个极缓慢的过程，必须经过长时期的选择和积累作用，才能够形成新的物种。而该理论则建立在基因能在很短的时间内快速改变的基础上。
达尔文认为生物体由体质和种质构成，环境的变化只能影响体质，这种体质与种质的绝对划分否定了获得性遗传，只强调了选择，并未考虑到生物的突变、基因重组、隔离等因素。科学家对拉马克用进废退和获得性遗传理论的肯定也侧面体现了进化论的不完善。
正如文章开篇所述，“我从哪里来”是人类历史最关注的问题之一，这一问题不仅仅是简单层面上的科学问题，更是关系政治、宗教、科学和文化的重要问题。本文只是在科学层面上对达尔文的进化论及其缺陷作简单分析，人类世界究竟是出自自然界必然运动的结果呢，还是出自一个智能的、巧妙的、拥有人类无法想象的神力的设计者仍是人类未解之谜。
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