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科研老司机的套路哲学(一)

 解螺旋 2020-08-27


作者:解螺旋·子非鱼

如需转载请注明来源:解螺旋·医生科研助手

导语

科研老司机说:一切皆有套路(规律),科研也不例外。miRNA作为当家花旦,在科研这个大舞台上摇曳生姿已久;而肿瘤治疗身为老牌明星,自然也保持长盛不衰之势,那么当miRNA碰见肿瘤治疗,是怎么碰撞出美丽火花,形成深得人心的CP呢?

然而,老牌明星出道已久,CP组合自然花样繁多,Car-T疗法、DNA甲基化修饰等等,无一不是科研汪们热捧的对象,那么miRNA小鲜肉要想一直得到肿瘤治疗明星大腕的青睐,没有几个傍身秘籍又怎么能行呢?好在自古深情留不住,总是套路得人心,那么小鱼通过两篇相关文章来深入分析下科研中用miRNA进行肿瘤研究的两个经典套路。
经典套路一


基于前期研究,已有报道揭示了MSC可作为催化剂促进癌症进展、侵袭和转移,然而其具体的分子机制并未阐明,因而,这篇文章通过一套完整的研究流程,阐明了肿瘤间充质干细胞(MSC)诱发的miRNA调节网络,并证实了转录因子FOXP2在乳腺癌转移中的关键角色。
 
其文章研究思路如下:
 

1.miRNA筛选,获取研究对象


此外,还需要排除细胞模型的特异性,即先用不同品系的乳腺癌细胞(BCC)与不同来源MSC共培养3天,检测所筛选的miRNA的表达率变化。
 

2.对筛选出的miRNA进行功能验证

研究者发现所得的miR-199a-3p可促使肿瘤干细胞的标记物乙醛脱氢酶(ALDHA1)的表达水平显著提高,并增强肿瘤的始发能力。
 
3.寻找并验证miRNA的靶基因

 

因不同体内细胞环境对miRNA的影响不同,可再次进行基因芯片筛选miRNA的靶基因,并关注那些与获得或维持肿瘤细胞干性有关的因素。

4.从靶基因的角度阐明miRNA的调控分子机制

经典套路二
当然,如果你已确定某一种miRNA与肿瘤的增殖、转移及治疗密切相关,而你又想知道其与某种肿瘤发生发展过程中的调控关系,可参考下面这篇文章的研究思路。

 

前期已有报道说明miR-490-3p与肿瘤的增殖、转移及治疗密切相关,但仅局限于现象性研究,具体涉及的信号通路仍未阐明。同时,尚未有文献报道miR-490-3p对结直肠癌发病和转移的作用及相关机制。
 
因而本文研究者通过体内外实验,明确了miR-490-3p与结直肠癌转移的关系及相关机制。其研究思路如下:
 
1.验证miR-490-3p与结直肠癌发病、转移及预后的关系

通过实验证明miR-490-3p在结直肠癌中的表达呈下调趋势,且与肿瘤的转移相关。且其高表达与病人的良好预后成正相关性。
 

2.验证miR-490-3p对结直肠癌肿瘤细胞增殖和转移的影响


结果证明,过表达miR-490-3p可抑制肿瘤细胞的成瘤能力及转移能力。
 
3.验证miR-490-3p及其靶点FRAT1的相互作用机制

通过实验证明已明确miR-490-3p的靶基因为FRAT1,进一步通过体外拯救实验,证实FRAT1能够恢复miR-490-3p对结直肠癌肿瘤细胞转移的抑制作用。此外, miR-490-3p靶向调控FRAT1的表达,促进β-catenin的的降解,抑制其核内定位,从而介导Wnt/β-catenin信号通路的活性,影响结直肠癌的转移。

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