转录组一定要测重复

 本帖最后由 hld8124 于 2016.5.17 17:22 编辑

第一个问题转录组一定要测重复的原因，与你做其他生物学实验一样，没有重复怎么知道你得到结果的可靠，转录组的重复，是为了验证获得基因的测序的可靠性与差异表达的可靠性。转录组的重复有2种，一是生物学重复，一是技术重复，你说单个样品间差异就很大，这是你的生物学重复不好，那你只做一个转录组，那这样的结果偶然性很大，要尽量选择培养条件一致的样做重复。关于多样品的混样，实际上不需要重复，但是做了最好，混合测序有一定的缺陷，因为混样本生会降低低表达量基因的检测。

第二个问题，转录组测完后为什么很多都有荧光定量验证，因为转录组测序是以数学模拟计算表达量，筛选的基因比较多，一定程度上会有误差，而荧光定量与转录组表达是不同的方法，是对特异基因表达量的检测，特异性相对更高。