理论上我前面提到的GEOquery包就可以根据一个GSE索引号来获取NCBI提供的所有关于这个GSE索引号的数据了,包括metadata,表达矩阵,soft文件,还有raw data 但是很多时候,那个metadata并不是很整齐,而且一个个下载太麻烦了,所以就需要用R的bioconductor的另一个神奇的包了GEOmetadb 它的示例:http:/// 里面还是很多数据库基础知识的 代码托管在github,它的示例代码是这样连接数据库的: 本文固定链接: http://www./1085.html | 生信菜鸟团 |
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