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生信分析本地化的来临

 sailing_387 2016-08-15

随着illumina平台普及化,越来越多的学者都拥有了自己的实验平台,简化的实验操作过程让测序的技术瓶颈荡然无存。但多数的老师就算有了自己的测序平台之后,还是偏向测序公司完成自己头疼的数据分析。今天我们来探讨一下制约大家进行数据分析的因素有哪些:

1.测序公司高昂的数据分析成本:

现在市面上最常见的数据分析莫过转录组分析,转录组测序截至201661日的市场均价是4000元(建库+6G数据+标准分析)。你可以问问当地销售我不要分析只要数据你大概可以给我个什么价格,一般的回答可能是2500元,如果您样本量大,1800元也不是不可以,这个价钱和自己买仪器自己测序的成本相差无几。那么问题来了,生信分析真值这么多钱吗?答案是真值这么多钱,每一个生物信息学分析高手都是有生物学背景的编程人员,工资待遇可想而知。一个课题组一半的测序经费就这样花在了纯分析上。如果你课题组有个会自己做分析的老师,恭喜你,你可以多测一倍的样本。

 

2.研究生专业不对口:

学习生物专业或者农业类专业的研究生,本科和研究生阶段都不会接受生物信息学的专业培训,学校里教的分析内容又极为滞后,专业的代码对他们不甚友好,课题老师有能力也没时间去进行专业培训。

 

3.算法变化快,数据库更新勤

本人认识一个很牛逼的海归教授,从我刚入行认识他,老师就在自己做数据分析。可谓自立自强之典范,每每见面就吐槽现在国际认可的算法变化快,差不多每年相同的分析算法就会出现革新,自己又要花很多时间去学习。数据库每个季度他都要去更新一遍,这些东西占用了他大量精力,但又不能不做。

 

4.数据私密性强,同行竞争激烈

帝都有同行在买卖健康人类外显子的数据200~500元一套,来源大多数都是云计算中获得的数据。这些数据可以作为阴性对照的数据库使用。现在各位想明白了免费的云计算是图你什么了吧。数据计算是个小众的产业,不是滴滴打车,这片市场没什么好孕育的。当然你的数据只是为了发文章也不担心被其他人引用,这就没啥好担心的了。如果你的数据还是有点价值的话,还是建议你做本地线下分析吧。

 

     只要能解决问题就会有市场,我们团队为了解决以上的四个问题推出了一系列本地化分析软件-VG。其特点如下:

1.一次购买终身受用,减少与测序公司的沟通成本和分析成本。

2.全软件安装在windows操作系统下,操作简单(操作类似连连看),分析迅捷,每一步都有使用方法和教学视频。

3.我们每个定期更新数据库,同步全球最广泛认可的算法,客户可根据个人喜好选择不同数据库和算法。

4.数据完全本地化,支持无互联网运算,无需将数据上传至云端。

本团队已经完成环境微生物分析系列软件,转录组分析软件将在6月底重磅推出。以下是软件试用版下载链接和教学视频:

http://pan.baidu.com/s/1i5jMQZb

http://pan.baidu.com/s/1i4qejhN


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