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如何绘制漂亮的多序列比对图片?#每天进步一点点#

 sailing_387 2016-09-08



先给大家讲个小故事,有一种只生长在中国最东边的竹子毛竹,精心培育,悉心照料,4年不过长3厘米,十分缓慢……




但是!第五年开始,每天就要生长足足30厘米!6周就可以长到15米!

 4年3厘米,6周15米…看似不可思议,只是因为4年里毛竹将根深深扎在土壤里,绵延数百米!

 我们身边也有这样的人,即使拼命,也看不到成果;即使不被人理解也坚持到底…当人们看到都以为他们很不幸或者是傻子的时候,却不知道他们不是不成长,只是在扎根!很深很深的根!等到时机成熟,就会一发不可收拾,登上遥不可及的巅峰!


  请不要放弃,人生需要储备…要知道,多少人,没熬过那三厘米……





现在信息非常发达,当我们每天了解多N多实验室发了N多文章,歆羡的同时,是否需要静下心来想想,如何培养自己?


我们潦草的阅读很多paper,是否真的对自己有所帮助?


学习毛竹,公众号持续推出“每天进步一点点”系列,拒绝标题党,拒绝无用信息,扎实每天进步一点点!


各个行业的大牛们,在给我们展现优美的数据时候,绘图功能往往也令我们刮目相看,小编最近也遇到如何绘制漂亮的多序列比对图片的苦恼,今天,我们的#进步一点点#围绕如何绘制多序列比对图片来开展~~





Clustal在多序列比对方面可谓是得天独厚,其中clustal Ω可以将成百上千的序列在一个小时内比对。

Clustal X是经典版,我们主要围绕他来开展。






然后按照指示,进行一步一步的安装:








 

点击File:选择载入序列:







是不是很好看那?

那么是否可以生成进化树?

当然可以!

我们选择aligment下的do complete alignment







然后我们使用treeview软件就可以观察:






小伙伴们,让我们一起记住毛竹的故事,一起每天进步一点点!!


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