在内功上，一直存在九阴和九阳谁更牛逼的争论。
从抗击打和治疗能力看，九阳无疑高于九阴，郭靖在修炼九阴真经十余年后，被欧阳锋打伤一掌，仍需养伤七日。反观张无忌，在屠狮大会着了周芷若的道，重伤呕血，没一晚上便痊愈，众皆骇然。而且张无忌在重伤后，仍能靠九阳的反弹之力击毙圆真教徒，自身毫发无损，这种抗击打能力已近乎少林不败金身。这是郭靖所不及的。
从威力看，九阴很可能高于九阳。为什么这么说？我们不要忘了内功的成长性。九阴源自《道藏》，与全真教玄门内功同出一门，属于后期选手（前期也惊人），厚积薄发，练10年和练30年完全是两个档次。所以郭靖20岁时明显弱于欧阳锋，30岁时已平手，40岁时虽然没有和欧阳锋交手的记录，但是无疑超越了老五绝。20岁的郭靖和40岁的郭靖，差距其实非常大。而张无忌在山谷里憋了五年，就能一口气把九阳练穿，虽说天赋秉异、仙果不断，但也说明了些许差异。后来张无忌又练了不少功夫，但是九阳神功始终没有进一步发展。
从实际战绩看，周芷若练九阴才个把月，张无忌在孤岛上给她疗伤（实为用九阳强压九阴）便累得满头大汗，最后感叹说芷若的内功将来绝不亚于自己。这是金书里唯一九阳选手和九阴选手单纯以内力对抗的情节，结合上一段的成长性差异，还是有所意义的。
当然，具体到郭靖和张无忌身上，两者的内功应当还是郭靖略高。这里借用张三丰的评语：无忌孩儿的眼神浑和内敛，这份内功修为当世只在郭大侠和觉远大师身上见过。（这也表明在神雕里，郭靖的内功超越了周伯通、黄药师、一灯、杨过等，毕竟他是唯一修炼全套九阴真经的男性。）郭靖在神雕结尾都56岁左右了，毕竟比张无忌足足多了36年左右的功力。这是两门神功威力相近时，比较选手水平所不容忽视的差距。
