1、驱杀虫制剂 元素碘对原虫和蠕虫有强大的杀灭作用，常用于驱杀寄生于鱼类肠道内的艾美虫，用法用量为：0.24g/kg体重或2%碘酊12ml/kg体重，拌入饲料制成药饵，每日1次，连用4d。此外还可治疗鲤嗜子宫线虫病。元素碘见光易挥发应避光阴凉保存；不可与含汞物质混合，否则产生碘化汞而呈现毒性作用。
2、调节代谢与生长制剂 碘化钾有补碘作用，通过甲状腺激素参与几乎所有物质代谢过程，若缺乏会引起坏卵多，鳞少、皮厚、皮下粘液性水肿，生长速度下降等现象；但过量摄入会导致动物中毒，一般饲料中添加量为3μg/kg体重或0.1mg/kg饲料。碘化钾水溶液与空气接触易分解析出I2而变黄，稳定性较差；其所释放出的游离碘，易影响维生素、抗生素等的效价。
3、消毒剂 （1）无机碘（如碘、碘酊） 碘在水中溶解度很小，其醇溶液能氧化病原体原浆蛋白的活性基因，与蛋白的氨基结合而导致蛋白质变性和抑制菌体的代谢酶系统。可用于杀灭附着在水生动物体表或受精卵上的芽孢和病毒，预防水生动物的各种病毒性疾病。
碘酊因同时含碘1.80%～2.20% （g/mL），碘化钾1.35%～1.65%（g/mL），形成可溶性的三碘化合物，使碘的溶解度增加数百倍，降低了挥发性。可用于水生动物体表涂搽消毒，用0.1%碘酊浸浴鱼类受精卵1～2h，再用紫外线杀菌后的水饲养幼鱼，能有效地防治虹鳟传染性胰腺坏死病的发生。因碘对胃肠道粘膜有毒性，易受碱性、还原物质、日光照射等影响而加速分解；碘酊对水生动物刺激性较大，现已较少应用。
（2）有机碘 目前市场流通的碘类消毒剂绝大部分为有机碘，对细菌、病毒、真菌具有良好的灭活效果，因其稳定性好、作用持久、刺激性小、残留低等优点而受到人们的青睐。
它是将碘与表面活性剂络合，再辅以增效剂、缓释剂等而成。由于与不同的表面活性剂络合，络合的间对位位置不同，辅助成分不一，生产出了应用于不同领域的碘制剂。
它们作用机理大致类同：碘直接卤化菌体蛋白质，产生沉淀；而表面活性剂一般对细胞膜有亲和作用，能将载有的碘与细胞膜、细胞质结合，使巯基化合物、肽、蛋白质、酶、脂质等氧化或碘化，从而达到杀菌的目的。
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