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生命起源研究取得重大进展,科学家首次实现“单对多”RNA复制

 红豆居士 2016-09-17

生命起源研究取得重大进展,科学家首次实现“单对多”RNA复制

「脑Q」是DT君系列新栏目中的又一成员,旨在报道最新的科学发现和技术发明,挑战脑力的底线。

在对生命起源这一宏大命题的研究中,

始终涉及三种不同类型的生物大分子:RNA、DNA和蛋白质。

对生命形成来说,三者似乎是一个缺一不可的完整体系。

1986年,诺奖得主沃特·吉尔博特提出“RNA世界假说”,

认为RNA可能是最早出现的生物大分子,

但科学家们却一直无法合成出这种兼备DNA和蛋白质功能的高效RNA。

直到最近,

科学家们终于在实验室里合成了一种叫做“核糖聚合酶24-3”的RNA分子,

它能对其他种类繁多的RNA分子进行复制,

为“RNA世界假说”提供了新的支持。

...

地球上出现的首个生物大分子是什么,一直是关于生命起源的最大的谜团之一。如今的细胞使用复杂的生物合成机制来制造DNA、RNA及蛋白等生物大分子。那么,在细胞出现前的原始生命又是什么样子的呢?

生命起源研究取得重大进展,科学家首次实现“单对多”RNA复制

电影《普罗米修斯》

一种称为“RNA世界假说”(RNA world hypothesis)的理论认为,RNA就是最初的生物大分子。RNA具有生物分子的两种基本功能:

1)编码信息(DNA的功能)

2)催化生物反应(蛋白质的功能)

生命起源之谜:“RNA世界假说”*认为,地球上早期的生物大分子以RNA形态最先出现,之后才有蛋白质和DNA。且这些早期的RNA分子同时拥有DNA的遗传讯息储存功能,以及蛋白质的催化能力,支持了早期的细胞或前细胞生命的运作。

也许,生命开始于能够进行自我复制,并将自身的遗传信息传递给下一代的RNA分子或类RNA分子。

*上世纪八十年代初,美国科学家托马斯·切赫(Thomas R. Cech)和西德尼·奥尔特(Sidney Altman)发现了RNA也是一种生物催化剂,称为RNA酶或者核酶,并因此荣获1986年诺贝尔化学奖。

同年,1980年诺贝尔化学奖得主沃特·吉尔伯特(Walter Gilbert)因此提出了著名的“RNA世界假说”,一跃成为当前主流的生命起源理论。

然而,“RNA世界理论”最大的问题在于,科学家始终无法在实验室合成出符合之前提到的这两项功能的高效RNA分子。

生命起源研究取得重大进展,科学家首次实现“单对多”RNA复制

自二十世纪九十年代以来,科学家们已能够合成RNA酶或酶性核酸,但这些分子并不能根据RNA模板复制出一模一样的RNA分子*。此外,已有的RNA酶也无法合成复杂的RNA分子。

*在正常情况下,科学家合成RNA核酶分子,只能对已知的RNA靶链进行互补复制。例如,将碱基序列为AACU的RNA靶链复制为互补的UUGA碱基序列的RNA互补链。

而真正的分子复制需要两个步骤:从原始链AACU到互补链UUGA,再次进行互补复制,得到与原始链序列相同的AACU复制链。

近日,科学家首次合成了可以构建各类RNA序列的RNA酶,可复制的序列长度高达24位。更重要的是,该聚合核糖酶实现了真正的RNA“复制”,而不是一般情况下的“互补复制”。这是前所未有的突破。

加州拉荷亚斯克里普斯研究所研究员大卫·霍宁(David Horning)和杰拉德·乔伊斯(Gerald Joyce)共同于上月在《 Proceedings of the National Academy of Sciences》中发表了相关的论文。

为了制造它,科学家们先对现有的核糖酶序列进行随机诱变,制造了数以亿计的不同版本的核糖酶。

生命起源研究取得重大进展,科学家首次实现“单对多”RNA复制

然后,他们用实验进化法(experimental evolution)对核糖酶进行了筛选:科学家们以两种复杂的RNA分子作为“标准”,只选取能够制造出这两种“标准分子”的核糖酶版本;接着,他们把筛选出的核糖酶版本再次进行诱变和筛选。

如此重复20多次,最终获得了聚合核糖酶24-3。

聚合核糖酶24-3的效率非常惊人——除了测试用的两种“标准”RNA分子外,它还能够复制多种其他的复杂RNA序列。此外,在复制简单的RNA分子方面,比“老版本”的核糖酶更为有效。

而最大的亮点,当然是聚合核糖酶24-3的“准确复制”能力,这要比普通的RNA制造困难得多更困难。

由于RNA复制的机制相对复杂,其他大多数核糖酶只能正确复制具有特定模式的RNA序列,而核糖酶24-3则几乎是一款“通用型”

当然,核糖酶24-3并非完美无缺,最明显的一点就是它能够复制其他的RNA分子,但不能自我复制

佛罗里达州阿拉楚阿应用分子进化基金会(Foundationfor Applied Molecular Evolution)生物化学家Steven Benner认为,尽管有缺陷,核糖酶24-3仍是证明“RNA世界”理论的重要一步。

目前的研究成果离揭开生命起源的奥秘还有很长的距离。科学家们在之前花了25年才找到核糖酶24-3这么一个能够“复制其他RNA”功能的RNA分子。

前面的路还很长,研究团队仍在不断改善核糖酶24-3,以期获得能够实现其“自我复制”的能力。

参考:

[1] Lincoln, T.A. and G.F.Joyce, Self-Sustained Replication of an RNA Enzyme. Science, 2009. 323(5918):p. 1229-1232.

[2] Horning, D.P. andG.F. Joyce, Amplification of RNA by an RNA polymerase ribozyme. Proceedings ofthe National Academy of Sciences, 2016.

[3] Sczepanski, J.T. andG.F. Joyce, A cross-chiral RNA polymerase ribozyme. Nature, 2014. 515(7527): p.440-442.

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