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学术干货 | 核磁共振好基友MestReNova—手把手教你做出一张核磁谱图

 Moia藏经阁 2017-01-30

核磁共振(NMR,Nuclear Magnetic Resonance)是基于原子尺度的量子磁物理性质。具有奇数质子或中子的核子,具有内在的性质:核自旋,自旋角动量。核自旋产生磁矩。NMR观测原子的方法,是将样品置于外加强大的磁场下,现代的仪器通常采用低温超导磁铁。核自旋本身的磁场,在外加磁场下重新排列,大多数核自旋会处于低能态。我们额外施加电磁场来干涉低能态的核自旋转向高能态,再回到平衡态便会释放出射频,这就是NMR讯号。利用这样的过程,可以进行分子科学的研究,如分子结构、动态等。

在对核磁进行分析的时候,小伙伴们一定离不开MestReNova这个基础软件。简单的分析想必大家都会,可是如果是要放在文章里的话,可能就需要下一番功夫了。今天小编带领各位看官一起做一张可以放在文章中的核磁谱图。(多图预警)


第一步:定标


要分析核磁图,首先要先会打开它(以小编做的一个材料为例,溶剂为CDCl3)。打开文件夹,选择任意一个文件(以acqus为例)后选择用MestReNova打开。我们最常用的就是下图中红色框内的几个按钮了。



打开之后的软件界面如下图。



首先用下图中红框按钮对想着重观察的区域放大,一般情况下我们首先观察芳香区,也就是化学位移在7左右的区域。



用红框中的键对溶剂峰定标(选择7.26附近的峰,将ppm值改为7.26)




第二步:标峰


选择图中红框图标,采用人工标峰。框选出你要标的峰,然后松手。



峰的化学位移值如下图所示。烷基区同上。



第三步:积分


选择图中红框选中按钮选择人工积分。标定之后如图中所示。



第四步:标定偶极矩


选择图中红框选中按钮,选择“Automatic”。



电脑就会自动对已经已经积分的部分进行计算。结果如下图所示。



一般来说,文章正文中不会出现核磁谱图,核磁谱图通常会放在supporting information里,文章正文中通常放文字。那么怎么将核磁图转化为文字呢?不要着急 ,且听我一一道来。


点选“Report”,在图表中就会出现核磁的文字分析结果。



选中之后,就可以直接黏贴在你的正文中了(别忘了删除框框哦)。


第五步:修饰、美化


分析正确之后,如果直接把这样的谱图放在文章里,总觉得和白花花的背景有些维和,为了让图谱看的更加和谐,我们就需要对其进行美化。


选择图中红框的“小手”,然后在空白处双击左键。


 

选择右边第2个选项卡,按图中所示,勾选掉3中的两个对钩,这样图谱中背景就会变成空白。



勾选掉“Vertical”,这样图谱中的纵坐标就没有了。



选择第3个选项卡,如图所示,选择合适的字体字号等。



选择第4个选项卡,如图所示,将“Curve”勾选掉,去掉曲线;将2%改为3%,将积分上移。



最后选择“OK”这样你就得到了一张漂亮的核磁图了。



为了使图形在放大缩小时不失真,我们需要把图形保存为矢量图。


选择File,save as,将保存类型设为tiff,保存为矢量图。



这样,一张可以放到文章中的标准NMR图就出炉了!


总结:

总体流程就是:定标、标峰、积分、标定偶极矩、美化。



如果能结合着Chemdraw,将化学分子式贴入核磁谱图中

少年,发Nature就指日可待了!


(Chemdraw使用教程参看学术干货|化工材料学子基础入门必备–ChemDraw的使用方法)


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