依形态变化划分为花芽分化初期、花萼分化期、花瓣分化期、雄蕊分化期和雌蕊分化期等5个时期。生理分化完成前后，在植株体内激素和日照、温度等内、外界条件调节影响下，叶原基的物质代谢及生长点组织形态开始发生变化，逐渐可区分出花芽和叶芽，这就进入了花芽的形态分化期，并逐渐发育形成花萼、花瓣、雄蕊、雌蕊，直到开花前才完成整个花器的发育。通常说的花芽分化期，即指形态分化时期。从11月下旬开始至次年的3月中下旬结束，历时120天。
在柑桔品种中，脐橙、普通甜橙和夏橙的花芽分化初期比宽皮柑桔早5天左右，初花期也相应早2～3天。甜橙类以花序花为主，顶芽先分化，然后按顺序由上而下的腋芽分化。宽皮柑桔多为复芽，一节有多个花芽，以中央一个先分化,随后两侧副芽依次分化。
(1)花芽分化初期：从11月下旬开始至12月中旬结束，约需30天，12月中旬进入分化高峰期，分化率为50%～75%。芽体外观显示饱满肥圆，鳞片紧包，主芽生长点开始向边缘扩宽，中央稍宽平。春梢比秋梢分化期约提早5天左右。
(2)花萼分化期：受冬季低温的影响，花芽分化初期到花萼分化期间隔时间较长，约需20～25天。花萼分化期从12月中下旬开始至次年1月中旬结束，为期20～30天，1月上旬进入分化高峰期。茂谷柑、砂糖桔和贡柑等，分化率为50%～75%；早熟温州蜜柑分化稍晚，分化率为25%～50%；不知火抽发晚秋梢，分化最晚，分化率为50%。
此时期芽体外形为鳞片外层向外微微松开，主花芽生长点宽平，两端微隆起，突出部分为花萼原基。副芽生长点突起变平宽，系花芽分化初期开始。同时叶芽生长点尖细隆起，1月中下旬生长点伸长冲破鳞片露出白点，即为春梢萌芽期。春梢萌动最早，次为秋梢。
(3)花瓣分化期：气温暖暖回升，花萼分化期到花瓣分化期相隔缩短至10天左右，并且出现两个分化期相互重叠分化。花瓣分化期从1月上中旬开始至2月上旬初结束，约需20天，1月中旬进入分化高峰期。此时，花茎伸长可看见小花蕾和幼小叶片，同时副芽进入花萼分化期。
(4)雄蕊分化期：从2月中旬开始至3月上旬初结束，历期15～20天，2月中旬进入分化高峰期，分化率50%～75%，各个品种差异不明显。此时花瓣发育增大呈现浅白色，同时营养芽伸长出现节间和叶片向外张开变大，即为春梢抽梢期。期间气温骤然飚升至25℃以上，雄蕊分化提早完成，花蕾变成花瓣短肥、雄蕊伸长突出的畸形花。
(5)雌蕊分化期：从3月上旬开始至下旬结束，历期10～20天。此时期雄蕊与雌蕊分化期相互重叠和交叉分化。然而，雌蕊分化期的特征以花蕾迅速增大与增长，呈乳白色状。分化拟分两个阶段，首先是柱头迅速伸长,顶端部分形成蘑菇状；次为子房外皮层发育成浅绿色，中心柱两侧排列整齐灰白色的胚珠，花芽形态分化期即告完成,并进入初花期。同时，副芽迅速分化和开花。
