生物信息学家们开始建立用户友好型的平台,以用于分析和解读基因测序数据。 医生在诊断没有明确病因的疾病时,依靠基因测序技术可能有助于诊断。但是测序生成的大量数据让他们难以招架。 直到几年前,位于利马的美国海军医学研究6单位(US Naval Medical Research Unit-6, NAMRU-6)的医生必须将序列数据发送回美国进行分析,这个过程需要几周——如果需要尽快做出医疗决定,这个时间太久了。该中心基因组学和病原发现部门的负责人Mariana Leguia表示,如果你能做的就是取得数据,然后不得不送回美国分析,那么这个技术毫无用处。 但是现在Leguia不再需要等待美国发回分析结果,就可以在几天甚至几个小时内得到结果了——她可以在自己的实验室进行相关分析工作!她所在的单位开始利用EDGE(Empowering the Development of Genomics Expertise)——一个可以完成常见微生物基因组学任务,如序列组装和物种鉴定的生物信息学工具。用户只需在界面上操作,就可以得到精确的结果。Leguia等人现在可以在现场操作,而且可以快速做决定。 |
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