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3D Slicer教程【软件安装及设置】

 卍老顽童卐 2017-04-12
【教程001】软件安装及设置

前言

我最先接触到3D Slicer的时候是2016年11月份,医院购买STORZ神经内镜,因有两个学习的名额,医院派我到301医院陈晓雷教授主办的内镜学习班学习了一天,陈教授的讲课非常精彩,最重要的是接地气,密切结合临床实际,收获颇丰。除了内镜学习之外,授课过程中反复提到3D Slicer软件,血肿重建、计算血肿体积、陀螺仪定位、虚拟脑室镜等功能,顿时觉得高大上的一个软件,居然还免费。

陈教授主办的3D Slicer软件学习班没有时间参加,只好自学。我的英文水平本来一般,网站的培训课件都是英文的,老版本的居多,与新版本模块很多名称都不一致,一些专业术语翻译软件也找不到,课件讲解也不是很细致,专业也不全对口。由于软件对电脑硬件水平要求偏高,于2017年1月份新配置了电脑,凭借自己的计算机基础加上热情,开始了艰难的自学,并且渐入佳境,肿瘤建模、CTAMRA三维重建、DTI纤维束成像等逐渐学会并应用于临床辅助手术计划的制定,原来CTA无法明确诊断需要进一步造影的部分病例通过软件都得到了圆满的解决。

自学过程中很多问题反复查找资料和文献,请教影像技师还得不到圆满的解决,2017年2月份建了一个3D Slicer交流群,和同行们交流软件的使用心得,这期间影像匹配、多模态融合,模拟入路及手术定位等一些难点得到解决,对软件的运用又有了一个新的认识,期间又交了一批志同道合的朋友,在此想把我们的学习经验写出来,供那些感兴趣的同道借鉴,尤其那些想学习又望而却步的初学者。

特别需要说明的是3D Slicer没有经过FDA批准应用于临床,本教程仅限于交流软件的使用方法,而不是侧重于临床的应用,因不是专门培训机构,错误之处在所难免,恳请批评指正。3D Slicer中国区培训是由301医院陈晓雷教授负责,每年都举办多期培训班并上机操作,3D Slicer入门之后建议到培训班进一步学习。

软件设置

打开软件默认进入Welcome to Slicer,通过点击欢迎界面的Customize Slicer、快捷键Ctrl+2Edit→Application Settings都可以到达软件设置界面。设置界面01General(一般设置)

02Moules(模块设置)03Appearance(外观设置)

Dark Slicer样式如下,可根据自己喜好进行选择。

04Views(视图)

05Extensions(扩展)

06Cache(缓存)

07Python(脚本)

08Developer(开发者)

09Extension Wizard(扩展向导)

10Units(单位)

11Subject hierarchy(主题层次)

12Volume rendering(实体重建)

扩展模块

很多新功能依靠扩展模块得以实现,通过下列方式进入扩展模块管理器。本教程得到束旭俊、霍贵通、霍显浩、江永、朱明启、王宏瑜、李闯的校对与润色,在此致谢!由于时间仓促,文中错误之处在所难免,望给予提出宝贵意见和建议。关注公众号鹤岗神经外科(HGsjwk),可以查看后续系列教程,如果有兴趣可以加入3D Slicer交流群。

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