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3D Slicer教程已经简介了阈值法、笔刷法【1】、魔杖法、快速推进法、稳健统计法、种子点法进行血肿建模操作，此教程将介绍应用模块GrowCutEffect的建模方法，数据加载及建模过程不再赘述，详见教程004，文末有链接。本系列教程的初衷主要想起到一个抛砖引玉的作用，希望对大家有所启发。再次重申，3D Slicer目前只作为科学研究，因学习本教程应用于临床所导致的一切后果与本教程编辑人员无关，属于个人行为，后果自负。 07GrowCutEffect（图像分割法） GrowCutEffect是一个功能强大的算法，通过选择不同的颜色在前景和背景区域进行绘画，至少要有2种颜色才能正常运算，暂且称作图像分割法（名称有待商榷）。需要特殊说明的是GrowCut只能在Short格式上正确运行，如果图像不是Short格式需要应用Cast Scalar Volume模块进行转换。 转换完成后进入Editor模块 首先选中颜色序号5用PaintEffect（笔刷）工具涂画血肿中心区域 再选中颜色序号1用PaintEffect（笔刷）工具涂画血肿周围区域 应用GrowCutEffect工具运行计算 运行结果如下图，可见血肿上下层面染色不全。按快捷键H调出导航线，按住键盘Shift键可使三个位置（轴位、冠状位、矢状位）同步变化到对应点，分别选中未染色区域的中心层面。 应用PaintEffect（笔刷）工具重复以上步骤对未染色中心区域进行染色如下图 再次应用GrowCutEffect工具运行计算 应用SaveIslandEffect工具去除血肿周边染色之后建模 操作要点： ① 笔刷染色选取颜色时直接在Lable框里面键入颜色序号即可，如果通过Add Structure增加颜色时，需要进行Merge All（合并所有）操作。 ② 血肿及周边区域染色时需要应用两种不同的颜色。 ③ 病灶体积不大时涂画一个层面即可，否则需要涂画多个层面。 ④ 可以3D立体涂画，那样在一个界面即可完成，虽然简洁但对涂画要求略高，不能越界涂画（文末链接视频中有演示）。 ⑤如果出现下面的对话框提示图像不是“short”格式，首先需要在模块Cast Scalar Volume中进行转换。 备注：目前选择区域图像为“float”格式，标签图像为“short”格式。GrowCut只能在“short”格式上正确运行。如果对选择区域图像不满意，可以将选择区域图像和标签图像转化成“short”格式（用Cast Scalar Volume模块）或者安装FastGrowCut扩展，使用其中的Fast GrowCutEffect编辑工具【2】。 FastGrowCutEffect工具集成在Editor模块中，支持多标签操作，功能更强大，需要在扩展模块中进行安装。
血肿及周边区域的染色与前相同，染色完成后，选中模块并运行。
快捷键G为开始运行，S为种子图像与分割结果之间进行切换，R为重置，具体操作过程省略。
实际上图像处理软件部分工具的使用及有些操作与3D Slicer有些算法有相通之处。
致谢：本教程得到3D Slicer研讨群诸位同仁的大力协助，在此一并致谢！他（她）们是：束旭俊、霍贵通、霍显浩、李珍珠、王奎重、程世奇、蓝欢、彭逸龙、赵端允、朱明启、江永、罗帷、谢国强、范恒怡、王宏瑜、李闯、袁饶饶、朱江、石海平等（排名不分前后）。 【1】霍显浩 宁夏医科大学 【2】束旭俊 江苏省淮安市解放军第82医院 本教程视频下载百度云链接: https://pan.baidu.com/s/1o8LPtm6 密码: 6xk2 |
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