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人类学杂记(polyhedron)

 小猫臭臭 2017-04-18

(2017-04-04 08:47:13)

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原文地址:人類學雜記——34. 漢、滿、土家族線粒體分佈作者:polyhedron

最近拿到一批實驗室內部的線粒體數據,統計結果挺有意思,拿出來和大家分享一下。主要工作由鄭鴻翔博士完成。


首先還是先讓大家熟悉一下線粒體(母系)樹的結構。線粒體的命名從大規則上跟Y染色體類似,也是大寫拉丁字母打頭,後面數字和小寫字母間隔,如M7a1a之類。但線粒體的命名從來沒有像Y染色體那樣開過國際大會,而是根據傳統逐漸添加的,所以有諸多混亂的地方。各單倍羣的分佈見http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf7901010f1b.html ,本文不多作重複。


大體上是這樣:靠近根部的,絕大多數非洲的類型是L,最早分出的是L0支系。走出非洲的所有支系的共祖是L3,其中M和N是走出非洲的兩大支,N下面的主體稱作R。除L M N R外,其餘的大寫拉丁字母都是相對小的支系,屬於M N R之下。主要是開始命名時先做的美洲土著,命名成了A B C D(其實這幾支在東亞、中國都有),然後把其他發現的亞洲、歐洲的支系分別從字母序的兩頭分別向中閒命名,最後剩下的就是L M N了。而且很多字母單倍羣之閒又有包含關係,比如C和Z包含在M8裏,K在U8b裏面(U又在R裏,R在N裏,N在L3裏)等等。即使是同一個首字母,數字之閒也有包含關係,比如美洲的D1包含在D4裏,D2包含在D4e1裏,等等。還有,B也不是一個全都有共祖的單倍羣,當時命名時是因爲有8281-8289位的9鹼基缺失,後來發現這個缺失很不穩定,是一個類似STR的東西,發生過多次重複突變,所以B4和B5有共同祖先,但B6是和R11最接近的。這些大概瞭解就好,需要査樹的時候,線粒體支系的權威网站是Phylotree http:///tree/main.htm


這裏僅把中國常見的支系的樹形列一下:


[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈

其中,標紅的爲本文中作統計的組。R下的JT、HV、U三支雖然並無排他的共祖,但其分佈基本都在亞歐大陸西部,中國比較少,因此合併統計。(分佈見http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf7901010f1b.html 。)


統計的範圍是母系爲漢族、滿族和土家族的樣本。因爲中國的家譜傳統上是不記錄母系來源的,很難向上追溯,所以我就以採樣時報的母系最遠的人的籍貫和民族來算了。如果採樣時完全沒有母系信息,則我按本人出生地>父系籍貫的順序來定母系的籍貫和民族。雖然可能不準,但也只能這樣了(所以以後統計還會根據信息的更正來修改)。母系滿族和土家族的樣本相對比較多,而且和漢族基本自由通婚,向上幾代通常追不清民族,因此這裏與漢族合併統計了。這裏因爲時閒緣故,未嚴格去除已知同母系的樣本,好在我這裏本來同母系的樣本就很少,不會造成太大的統計偏差,但以後有時閒了也會修正。


按地區算時,人數太少的相鄰省份合併,保證每個統計的區域有50人以上。


後面一個個按單倍羣說。中國的M和N幾乎各占一半(M 52%,N 48%)。M主要是D4、D5、G、M7、M8(含M8a、C、Z)這幾支,其它的各種小支系零星有不少,比如M9、M10、M11、M12、D6、M33、M61等等。


M*(此處包括M33、M61、M62、M49、M20等)整體不到1%。

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M7占全國8%左右,華南明顯偏多。

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M8(含M8a、C、Z)全國約11%,似乎中部偏多。

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[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈M8

[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈C



M9占全國2%左右,M10和M11各占1%左右。

[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈M9

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[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈M11


M12'G主要是G,共占7%左右。

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[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈G


全體D在全球的分佈:

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D下分D4、D5、D6三支,D4是中國北方最常見的單倍羣,占全國的15%左右,華北和東北超過20%。

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D5'6支系全國7%左右,下面主要是D5,也是北方略多一些,D6很少。

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以上是M。後面是N。N*(xA,N9,R)在中國數量極少,忽略不計。N9(含N9a、N9b和Y三支,中國大部分是N9a)占5%左右。

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[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈N9a

[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈N9b

[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈Y



A在全國約8%。

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R9分爲F、R9b、R9c三支,其中F是絕對主體。R9共占全國17%左右,是全國最大支系,分佈南方居多(與D4相對)。

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[转载]人類學雜記——34. <wbr>漢、滿、土家族線粒體分佈F



R11'B6支僅占1%左右。

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B4'5整體的全球分佈:

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B4在全國有13%左右,東南方偏多,波利尼西亞模式型(Polynesian motif)B4a1a1也屬於本支。

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B5占4%左右。

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西方常見的JT'HV'U在漢/滿/土家中不到1%。

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整體上M的比例(因爲中國沒有L,除掉M的都是N了):

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整體M在全世界的分佈:

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