行政事业单位差旅费为经常性支出项目，具有数额大，审核难度大的特点。近年来，随着各级严控“三公经费”文件规定的出台，行政事业单位“三公经费”管理不断加强，而差旅费支出一直未成为单位管理和审计部门盯防的重点，从近年来部门预算执行审计情况来看，差旅费占单位公用经费比例逐年上升，违规报销差旅费的问题较为严重，在审计中不容忽视。 从审计情况看，部分单位差旅费报销项目中，除正常报销住宿费、车船费以及相关补助外，还报销电话费、目的地交通费、进餐费、办公费等项目。现行各级制定的差旅费管理办法规定，对城际间车船费、住宿费在标准限额内实报实销，对目的地交通费、公杂费以及出差期间伙食费都实行定额补助。有的出差人既按标准报销了各项补助，又违规报销了目的地的交通费、电话费、进餐费以及与出差无关的其他费用。
 一是超标准报销交通费和住宿费。部分单位人员借招商引资名义，到外地出差超标准乘坐交通工具，常见的是乘坐动车一等座、列车软卧、轮船飞机商务舱等。在住宿方面入住高档次宾馆，导致费用超标。在市内出差，有的人员贪图方便享受，不按规定选用交通工具，以工作需要为名，违规租用小汽车。二是超标准领取包干补助。差旅费管理办法都明确规定了不同地区的相关费用补助标准，但部分出差人员仍然直接或变相超标准报销补助。
 一是住宿费支少开多。有的人钻制度空子，出差时住价格较低宾馆，但按最高限额开票，套取差额。二是合并开票。有的人将进餐费、的士费等实行包干补助的费用计入住宿费，合并开票报销，再按标准领取补助，损公肥私。三是开假发票。部分人员在出差期间食宿由接待方统一安排，也未按规定向接待方支付相关费用，但通过开假发票报销费用，贪污公款。还有部分人员出差期间住亲朋好友家，但为私利开虚假住宿发票报销，有的甚至拿非住宿发票来冲抵住宿费，套取公款。 
因近年来对乱发津补贴的问题控制严格，部分单位为给职工发放福利，在差旅费上作文章，每月按固定的天数作为基数，依据相关的出差补助标准计算金额，按月发放到人，使差旅费项目完全变了味。从审计情况看，有相当部分单位有发放固定差旅费的现象，其标准在每人每月500元至1000元之间不等。
 有的单位将明令禁止的公款旅游费用以差旅费名目报销。在某单位预算执行审计中发现，某月差旅费报销原始凭证中，有单位所有退休职工从本地至外省某地的火车票、相关景点的门票以及该地区住宿费、进餐费发票。经调查，单位承认是组织退休老同志到该地旅游，在差旅费中报销旅游费用。
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