TCGA projects 里面包含的癌症种类非常多,但是我们分析数据时候常常用pan-cancer 12,pan-cancer 17,pan-cancer 21来表示数据集有多少种癌症,一般文献会给出癌症的简称或者全名:BLCA, BRCA, COADREAD, GBM, HNSC, KIRC, LAML, LGG, LUAD, LUSC, OV, PRAD, SKCM, STAD, THCA, UCEC. Acute myeloid leukaemia HCD features: download 这是高置信度的癌症驱动基因列表:共280多个基因 这是一篇对接近5000个癌症样本的研究得到的癌症相关基因列表:共230多个基因 参考:http://bg./oncodrive-role/ http://bioinformatics./content/30/17/i549.full http://www./nature/journal/v505/n7484/full/nature12912.html?WT.ec_id=NATURE-20140123 |
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