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底质的好坏直接影响水质，水质的好坏是底质的表现形式，通常人们是通过水质的变化才知道底质的变化，改善底质是改善水质的基础。病原通过塘底的有机污染生长繁殖，再通过水体扩散传播，因此养水先改底。
（一）改底的误区
经调查，市场80%以上的底改产品都是名不副实带有很大投机性和欺骗性，绝大部分都是以大量的低质石粉加少量的化学产品混合而成，用了以后多絮凝或吸附沉积到塘底，形成“聚毒层”，表面上是水好了，实际上是底坏了，表面上这类产品低价实惠，实际上后患无穷，代价难以估计。
一旦发现底质腐败，发热发臭，河蟹不正常，则心里焦虑无比，投放大量的底改产品，包括大量的微生物制剂，造成溶氧降低养殖动物应激。
（二）提倡生物护底
底质养护的的方法，提倡用微生物型底质改良剂，采用微生物技术改良、养护底质和水质，是养殖技术的重大突破。充分利用复合微生物中各菌种的功能优势，发挥其协同作用，将残饵、排泄物、动植物尸体等影响底质变坏的隐患及时分解消除，不仅养护了底质和水质，而且控制了病原微生物及其病害的蔓延扩散。
这里特别提醒的是“养底、护底”而不是“改底”，应将上述产品少量多次地合理使用，使底质由坏到好是在渐变中（而不是在剧变中）完成。
（三）不良底质的种类
● 发黑发臭型底质
● 板结型底质
● 泥皮型底质
● 青苔型底质
其中发黑发臭型底质
1、形成原因
（1）投饵过量，饲料腐败变质。
（2）养殖水深与增氧能力脱节，造成底部溶氧不足，底泥黑臭。
（3）经常使用化学消毒剂或吸附性底改，造成底部有毒有害物质沉积，底泥发黑发臭。
（4）水草（特别是伊乐藻）沉底腐烂，造成底部黑臭。
（5）大量爆发蓝藻的池塘，由于蓝藻死亡堆积，造成底部变黑变臭。
2、处理方法
（1）水源较好的情况下，想办法排底层水，排去池底污物，引进新水源。
（2）定期分解底部有机质，消除黑臭。
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