手把手教你做——那些不用做实验就能发的文章（2）筛芯片

挖掘机技术哪家强？不做实验写文章……啊就好棒棒！

好吧好吧，不做广告了，不是为了让你们真的都去灌那些不用做实验的文章哈。其实挖掘出了数据，也可以作为一个课题的开始，只要经过后期的验证，也是不错的哦，起码能省一些前期的经费。

好了，上次用GEO简单挖掘了一些芯片，但是关键的问题并没有讲。什么关键问题呢？呃，就是如何筛选芯片。

这个确实让人头大的，比如我要选肿瘤的芯片，我只会这样：

嗯，结果有五十七万个……我要怎么选芯片啊！其实也不难，点击这个Advanced，开始高级搜索：

点击后就能进入到高级搜索界面，进入之后，就可以按照关键词属性来进行搜索了：

我们要筛选芯片需要的准则是：

1）搜索相关疾病（这基本是废话）

2）有样本类型（尽量都是同一水平的，比如RNA或者蛋白芯片）

3）有样本属性（尽量都是相同的属性的，比如都是组织样本，或者都是细胞系样本）

4）芯片类型（当然都应该都是RNA芯片，或者都是lncRNA芯片，否则没法取交集是吧）

5）最后做关键的，样本量不能太少（你一个芯片就一两个样本，并没有什么卵用吧）

于是，我们的搜索关键词就变成了：

但是！样本量怎么办！要怎么样选样本量啊！其实在Advanced搜索里，是有样本数量的：

可是这里面不能用“<”“>”“=”这样的运算符来筛选的，所以要么全选，要么就要换另一种方式。

这就需要用到GEO的Filter了，没错，不光是PubMed有FilTer，其实GEO也有它的Filter，点击Manage Filter：

点击“Create custom Filter”，把我给你们的筛选数值bia进去，嗯，这是100-1024个样本的滤器，所以就命名1024哈：

保存后，记得激活打钩哈！别再跟我说为啥不能用了。

然后，我们的芯片搜索，就变成了：

可以直接看到，含有样本量从100个到1024个的芯片有31个了，接着就在这里面找你要的东西吧。

…华丽丽的分割线…

李莫愁博士：是不是觉得很神奇？要不自己试试看吧，哦，对了，还没给你们这个筛选的滤器是吧？回复“GEO的样本筛选”就给你吧，把里面的文本复制粘贴进去就好了。今天就先策到这里吧。

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