TBtools一直在更新,开发者CJ最近增加了一个新的工具——(快速)绘制基因结构图,可以快速分析基因结构。今天我们来详细介绍一下这个工具的使用方法~使用TBtools绘制基因结构图,需要准备至少一个,最好两个输入文件:
写再多的使用说明都不如一个示例,毕竟是个GUI工具。下面以拟南芥的MYB基因家族为例,展示一下批量输出的步骤。 首先下载和准备TBtools需要的输入文件(在本例中是拟南芥的GFF3文件)。ftp://ftp.arabidopsis.org/home/tair/Genes/TAIR10_genome_release/TAIR10_gff3 准备拟南芥所有MYB的ID 列表,也可以不准备,不过就需要自己先筛选并且只保留MYB相关的拟南芥的记录,点击跳转,拟南芥有168个MYB,如果要用GSDS_v2在线输出结果,那么可能会达到文件上限,于是就做不了,这个时候,你需要做网页工具本地化,还是可行的;不过TBtools更方便,只要给够内存,无限个都可以做。 出图并直接调整图片大小。 在TBtools中直接进行图片调整,改变高度或者取色器直接修改颜色。 当然,支持自定义Feature是必须的。
附上一个课题组秒出的图,中间和右边部分,发工具过去,等几秒,收到QQ消息…… 秒出 !!!还有隐藏功能!!!点击某处,弹出序列,惊不惊喜,意不意外?最新版的TBtools下载地址: http://www./forum/thread-1062-1-7.html
|
|