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安全无毒 | 是谁带你离开被EB统治的过去!

 stingray928 2017-07-27

对于我们这些跑胶就像吃饭一样平常的人而言,此刻,你是否还能回想起那段曾被EB统治的琼脂糖凝胶电泳的过去……


图源:eastday


记得那时我们总是硬着头皮和EB打交道,忍受着它可能造成的诱导突变的机制,忍受着其可能造成的遗传方面的潜移默化危害,甚至是废液的处理也只能小心翼翼,生怕造成安全隐患,造成环境污染。


幸运的是,现在已经有了InvitrogenTM SYBRTM safe DNA,作为安全无毒的EB替代品,出现在我们的实验生活中。今天我就来跟大家详细介绍一下它:



SYBR Safe DNA凝胶染料是一种高灵敏度的染料,可用于琼脂糖或丙烯酰胺凝胶上的DNA染色。SYBR Safe染料采用了独特的配方,是更为安全的EB替代物,可用蓝光或紫外光激发。


SYBR Safe染料可提供浓缩液或即用型溶液两种形式,使用方法与EB溶液类似。该染料还适用于凝胶中的RNA染色。


它,让克隆效率更高


我们的科学家已经证实,采用SYBR Safe DNA凝胶染料染色并通过Safe Imager? 蓝光透射仪观察DNA片段,相比采用EB染色通过紫外光观察,克隆效率得到明显提升。


图1. 使用SYBR Safe DNA凝胶染料来提高克隆效率。lacZ insert基因和β-gal载体一起凝胶电泳。然后分别用SYBR Safe DNA凝胶染料或EB染色,分别在蓝色透射仪或紫外下曝光,最后X-gal培养基上筛选(A)。不同曝光时间的蓝斑数量如图B所示。数据为平均曝光三次所得。


EB/紫外光培养板上的集落总数明显低于SYBR Safe/Safe Imager培养板上的集落总数,即便是实验开始阶段亦是如此 。随着时间的延长,EB/紫外光组培养板上的活的集落数从近15,000降至不足500,表示克隆效率下降近30倍。而在所有时间点 (包括120秒时间点),SYBR Safe/Safe Imager组培养板上的集落数仍维持在对照水平附近 (>12,500)。由此可见,使用SYBR Safe DNA凝胶染料和Safe Imager 蓝光透射仪大大提升了克隆效率。


它,保护您的个人安全


第三方独立实验室对SYBR Safe染料进行了一系列毒性评估,包括原代培养物的形态转化分析,染色体畸变和正向突变分析、回复突变分析、口服毒性分析等,结果表明相比EB,其导致突变的几率更低,使用蓝光激发的方式进一步减少了实验人员暴露于紫外光的危险,充分保护您的个人安全。


SYBR Safe DNA凝胶染料对哺乳动物的遗传毒性分析

点击可浏览大图


回复突变分析 (Ames测试)

与EB相比,SYBR Safe DNA凝胶染料在标准Ames测试中的致突变效应更低 (测试几种不同的鼠伤寒沙门氏菌菌株)。在该测试中,SYBR Safe DNA凝胶染料在七种菌株中的四种中出现了弱阳性 (仅采用哺乳动物S9组分激活)。



口服毒性分析

单剂量口服给药SYBR Safe DNA凝胶染料,限定剂量为5,000 mg/kg,未出现死亡或毒性症状。



它,具有卓越的灵敏度


SYBR safe DNA染料与EB的灵敏度相近,检测DNA的灵敏度为3 ng, RNA 1.5 ng;而EB为检测DNA 1 ng, RNA 1.5 ng。此外,SYBR safe DNA染料可兼容所有的下游应用,我们测试过凝胶中的PCR产物回收,凝胶纯化,Gateway cloning, TOPO cloning和限制性酶切克隆等。如果您有特殊的应用需求,可以联系技术支持获取帮助。


它,可通过蓝光或紫外光激发


SYBR Safe染料与核酸结合后,最大荧光激发波长为280和502 nm,最大发射光波长为530 nm。我们优先推荐您使用蓝光激发,比如Invitrogen Safe Imager仪器,无需滤光片,可以直接观察。如果下游实验为克隆,SYBR safe染料和蓝光透射仪配套使用,可大大提高克隆效率。因为相比紫外光,蓝光对DNA的损害最小,对人体的安全性更高。



当然,您也可以使用紫外凝胶成像系统。采用激发光源范围为紫外光或470 nm至530 nm的成像系统观察并分析染色DNA。如果您现在使用的是EB和紫外凝胶成像系统,我们建议按照凝胶成像仪制造厂家的推荐更换使用相应的滤光片,以获得最佳的灵敏度和成像结果。

它,对环境无危害


基于全面的环境安全测试,根据美国联邦法规 (资源保护及恢复法案 (RCRA)),SYBR Safe DNA凝胶染料不属于有害废物,可直接处理。SYBR Safe DNA凝胶染料符合净水法和国家污染物排放清除系统 (NPDES) 的规定。

经第三方独立实验室严格测试:

  • 根据环境保护署 (EPA) 的指导原则,SYBR Safe DNA凝胶染料不属于腐蚀性、易燃性或反应性物品 。

  • 根据国家污染物排放清除系统 (NPDES) 指导原则进行测试,发现SYBR Safe DNA凝胶染料与0.5X TBE缓冲液并无明显差异 。

  • 就有机污染物含量方面而言,0.5X TBE稀释的SYBR Safe DNA凝胶染料与单独的0.5X TBE无差异,两种样本的各种有机化合物检测结果均为阴性 。

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