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“宏基因组”文章目录软件和数据库使用SILVAngs: 扩增子16S/18S免费在线分析
antiSMASH: 微生物次生代谢物基因簇查询和预测
微生物网络构建：MENA, LSA, SparCC和CoNet
Genevestigator: 查找基因在发表研究中的表达 测序分析常用图表解读1箱线图：Alpha多样性，老板再也不操心我的文献阅读
2散点图：Beta多样性，组间整体差异分析
3热图：差异菌、OTU及功能
4曼哈顿图：差异OTU或Taxonomy
5火山图：差异OTU数量及变化规律
6韦恩图：比较组间共有和特有OTU或分类单元
7三元图：美的不要不要的，再多用也不过分
8网络图：节点OTU或类Venn比较 科研经验1云笔记积累个人知识体系
2云协作建立实验室工作总结和内部资料共享平台
3公众号建立实验室共享知识体系和宣传窗口
宏基因组14天原创-诚邀同行共享研究经验
如何注册一个名字好记的公众号 文献笔记Nature Review：Microbiota, metagenome, microbiome傻傻分不清
Nature：功能微生物组—甘露糖苷选择性抑制致病性大肠杆菌
Nature: 植物微生物组开山—拟南芥根微生物组的结构和组成
Microbiome: 简单套路发高分文章—白杨内生和根际微生物组结构 QIIME2教程1简介和安装
2人体微生物组分析实战Moving Pictures
3粪便菌群移植分析实战FMT
4沙漠土微生物组分析实战Atacama soil
5数据导入 6数据导出 7实验设计编写
8数据筛选 9训练物种分类器 QIIME1虚拟机安装 2Docker安装 3管理员安装 生信宝典精选文章软件使用提取指定位置的基因组序列
查找指定基因的调控网络 经验心得生物信息之程序学习
如何优雅的提问 Linux Shell命令运行监测和软件安装
管道、标准输入输出
常见错误和快捷操作
文件排序和FASTA文件操作
文件列太多，很难识别
服务器数据定期同步和备份方式 Python学习极简教程1 2 3 4 5 6 Pandas像R一样处理数据 ETE绘制进化树 R统计绘图入门环境Rstudio
基础概念和矩阵操作
一文看懂PCA主成分分析
热图绘制 (heatmap) 热图美化 热图简化
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箱线图,小提琴图,区域散点图 箱线图一步法
散点图绘制 富集分析泡泡图 火山图
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