近几年LncRNA研究的国自然立项数连年增长,2016年261项,2017年更是达到了345项。LncRNA的相关研究也逐渐成为了当今生命科学最热门的研究领域之一。 ChIPBase 提供LncRNA的表达图谱和转录调控的全面鉴定和注释。整合了高通量的RNA-seq鉴定的lncRNA及其表达图谱和ChIP-Seq实验技术鉴定的转录因子结合位点。网站:http://deepbase./chipbase/ LNCipedia LNCipedia:对人类LncRNA的序列和结构全面的注释。网站:http://www. lncRNABase lncRNABase:提供miRNA调控LncRNA、假基因(pseudogene)和circRNA的互作信息和ceRNA调控网络。这些调控互作网络信息是基于高通量的CLIP-Seq实验数据。网站:http://starbase./mirLncRNA.php lncRNAdb lncRNAdb:提供有生物学功能的LncRNA的全面注释。这是LncRNA研究领域的大牛John mattick实验室构建的网站。网站:http://www./ LncRNADisease LncRNADisease:提供了文献报道的疾病相关的LncRNA的注释。网站:http://cmbi./lncrnadisease NONCODE NONCODE:提供对LncRNA的全面注释,数据库收录多达16个物种信息,网站:http://www. NRED NRED:提供人和小鼠的LncRNA在芯片数据的表达信息。这也是John mattick实验室构建的网站。网站:http://jsm-research.imb./nred/ Arraystar Arraystar:miRNA-lncRNA互作的数据库。网站:www.arraystar.com starBase starBase:提供miRNA调控LncRNA、假基因和circRNA的互作信息。网站:http://starbase. DIANA-LncBase DIANA-LncBase:提供基于2个研究的CLIP-Seq数据miRNA调控LncRNA的信息。网站:http://www./LncBase miRcode miRcode:一个LncRNA转录组中推断的microRNA靶点图,当前版本中包括了10,419个LncRNA基因。网站:http://www. 下期预告 1.LncRNA研究方法及典型文章分析 2.近两年生物/医学领域国人发文最多的6-10分期刊盘点 |
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