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常用的模式生物数据库汇总

 刘芸47b4za497a 2017-11-14

模式生物在科研中的重要地位不必多说,今天给大家汇总了一下常用的模式生物数据库。

MGI,Mouse Genome Informatics,http://www.informatics./

比如我们搜个TP53,可以查看基因信息, 相关疾病,突变、等位基因和表型的信息,不同组织中的表达量,GO注释信息,相关miRNA。

RGD,Rat Genome Databasehttp,http://rgd./wg/home

RGD拥有着强大的在线分析和可视化的工具

比如蛋白之间的相互作用分析和可视化

SGD,Saccharomyces Genome Database,https://www./

ZFIN,The Zebrafish Information Network,http:///

基因信息查询

Xenbase,http://www./entry/

Xenbase不仅提供了相应的基因信息查询,还提供了实验Protocols和试剂(抗体等)的查询

WormBase,http://www./

这一数据库包含的物种较多,大名鼎鼎的秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)自然也包含其中。

同其它模式生物数据库一样,查询分析样样俱全

Flybase,http:///

生物学家们是真的欠果蝇一个诺奖。。。但是又觉得这样说似乎对小鼠不太公平。。。

TAIR,http://www./

在之前的文章有比较详细的介绍过,这里给一个传送门——植物研究,没你不行!

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