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仔猪水肿病与链球菌感染引起的脑膜炎在临床上都会出现急性死亡、都会出现神经症状，很容易混淆。 临床实践上可通过以下几点进行区别并做初步诊断： (1)听叫声 仔猪水肿病由于患病猪喉头、声带等发声组织和器官发生水肿，表现为叫声嘶哑;链球菌型脑膜炎由于患病猪神经多处于敏感或兴奋状态，一般会发生尖叫、空嚼和磨牙。伪狂犬初期叫声尖锐后期喉头出血坏死叫声嘶哑。 (2)看运动 仔猪水肿病患病猪所产生的运动障碍常在四肢同时发生;而链球菌引起的脑膜炎的患病猪所产生的运动障碍常有侧重，或前肢重、或后肢重或一侧重，典型的脑膜炎病猪同时伴有转圈现象。伪狂犬四肢运动不协调，后躯麻痹，患猪眼球震颤，意识模糊，嗜睡。 (3)测体温 仔猪水肿病的患病猪体温一般处于正常范围，而链球菌性脑膜炎的患病猪猪体温一般会有升高在42度左右。伪狂犬体温多在40-41.5d度。 (4)查粪便 仔猪水肿病的患病猪在发病初期常伴有腹泻现象，而链球菌型脑膜炎的患病猪常出现便秘。伪狂犬多有蛋花样下痢; (5)看体表 典型的仔猪水肿病的患病猪一般会出现眼睑水肿、头部皮下水肿，一般不会出现皮肤颜色的变化，而链球菌型脑膜炎的患病猪常常在耳尖、四肢下端、腹部等部位出现发绀。伪狂犬多见眼眶发红， （6）脑膜炎有口吐白沫的现象，伪狂犬很少有此现象;水肿均无。
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