干货 | 真正三步分析TCGA数据，多一步算我输

想做癌症研究没有足够的数据？想做多种肿瘤联合分析来发篇深度好文？想验证自己数据及研究方向的准确性？

这些问题通过对公共数据库的利用不失为一个好的解决办法，今天给大家介绍的就是TCGA数据库。

TCGA作为目前最大的癌症基因信息的数据库，包含39种常见癌症，1万多肿瘤样本，多种数据类型 ( 基因组、转录组、表观遗传学数据、临床数据等) ，蕴藏着难以想象的宝贵信息，围绕TCGA已经有很多重量级文章出现，而且对它的使用必然愈发重要。

如果你有较多时间，可以自学R语言，也有生信背景（有较好的研究思路等知识），同时对于到国外网站上下载TCGA数据也没有什么困难的话，那么自己下载TCGA数据再经过整合数据和利用相关软件和编程语言去分析就是比较好的利用TCGA数据的方式了。

而如果你对于整合数据、编程没有任何基础的话，那么这个就是相当难的事情了。

给大家看一张GCBI老师在讲解如何利用TCGA课程时众多小伙伴们的弹幕吧！

而对于这些医生，GCBI新上线的快速分析功能帮你三步轻松分析TCGA数据，满足你的所有需求。

快速分析

结合GCBI数据 功能，搜索数据，进行精品数据筛选，然后只要勾选数据集（此数据集为TCGA的RNA-SEQ数据）和分析目标，快速数据分析模块即可自动分组样本并进行分析。

是的，你所要做的就是搜索数据，勾选，选择分析目标这三个步骤然后就可以坐等结果了（其实不用坐等，最长分析时间也只有30分钟，大多情况下也就几分钟），虽然和之前自己分析TCGA数据同样是三个步骤，但是难易方便程度的巨大区别是一目了然的。

01

进入数据 页面

直接在数据 页面搜索数据，有对应的TCGA可进行快速分析的数据即可进行下一步或者直接进入快速分析入口直接找到相关TCGA数据。

02

选择数据集和样本特征

选择数据集和样本特征，以及确定样本分组信息。

点击control设置对照组。（只能设置1组对照组）

03

选择分析类型

目前可供分析类型为下列5个：

     （1）挖掘与样本特征相关的基因

     （2）解析样本特征影响的生物学功能

     （3）解析样本特征影响的信号通路

     （4）研究特征相关基因间的调控关系

     （5）识别特征相关的核心基因

最后就是填写接收结果的邮箱，完成订单（一个分析模块需支付500元），坐等结果了！

怎么样？相比自己下载TCGA数据进行整合分析，是不是在方便程度上上升了好几个数量级？

转载 | GCBI数据库

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