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胃镜是检查胃部情况最清晰直接的办法，但胃镜做的时候有痛苦，所以很多人畏惧，为此会选择一种无痛的检查方式，这就是“呼气实验”，有的医院为扩大宣传甚至告知病人，只要“轻轻吹口气，就能查胃病”，事实上，呼气试验绝对不能替代胃镜，因为前者只是检测胃中的细菌， 并不能反应胃部的全部真实状态。
随着幽门螺杆菌感染在胃十二指肠疾病发病中作用认识的统一，能检测幽门螺杆菌的 呼气试验日渐普及，但这个试验，仅仅能检测幽门螺杆菌感染，呼气试验阴性，不等于没有胃病，部分慢性浅表性胃炎、萎缩性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡或胃癌，都没有幽门螺杆菌感染，或由于服用了某些药物影响幽门螺杆菌的检测，出现假阴性，因此呼气试验不能替代胃镜检查，要知道患何种胃病，需要胃镜检查。
现在，随着胃镜镜子质量的不断提高和操作医生技术的不断熟练，半数以上病人接受胃镜检查时仅有轻度不适感。一般熟练医生在3-5分钟内即可完成胃镜检查，遇到复杂病人也很少超过10分钟，现在很多医院都有“无痛胃镜”，通过安全的麻醉办法，使整个胃镜检查过程就像睡了一觉一样，没有感觉，胃镜做完后就可以马上清醒，如果确实有检查的必要，胃镜是不可替代的，包括X光-钡餐，也无法替代胃镜。
除了胃镜检查可直接看到食管、胃、十二指肠粘膜，更重要的是，胃镜下可取胃粘膜活检，这对胃粘膜的细胞变化及早了解，因为胃癌等恶性疾病最初的变化是细胞，而不是能通过X光看到的局部凸起，真的到了有凸起的时候，往往已经是疾病后期，要先及早诊断和治疗，病理检查是最好的办法，在医学上叫“金标准”，而这个“金标准”，只能通过胃镜的活检来获得，这也就是胃镜的不可替代之处。
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