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Nature Biotechnology: 可同时对数千个细胞进行有效分析的高通量技术,其能将成本降...

 集美大哥 2018-05-20



   人类机体中有37万亿个细胞,然而将一种细胞与另外一种细胞进行区分的能力或许并不像我们想象中那么简单,近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自美国俄勒冈健康与科学大学(OHSU)的研究人员通过研究首次开发出了一种新方法,能够快速且有效地识别体内细胞的亚型,相关研究或能帮助研究人员在分子水平上理解多种人类疾病的发生机制。



  研究者表示,这种新技术或能帮助研究人员开发出治疗多种疾病的精准疗法,比如癌症、破坏大脑神经元的障碍,以及影响心脏和血管的疾病。同时这种技术还提供了一种新方法来扩大此前研究人员分析细胞类型的方法,这种方法是通过对DNA进行化学标记来对细胞进行有效区分的。



  研究者Adey教授指出,这种技术在任何有细胞类型异质多样性的环境中都是非常有价值的,我们的主要研究领域是癌症和神经科学,但我们也希望将该技术应用于心血管疾病的研究中;所有细胞都携带着相同的基因组,即具有编码功能的完整基因集合,在既定细胞中基因表达的模式能够帮助研究者有效区分神经元细胞和肝脏细胞。



  即使那样,事实证明相似的细胞之间也会有区别,2017年研究人员就通过测定不同细胞间的化学标志物,即DNA的甲基化模式,来有效区分神经元的类型。这项研究中,研究人员就开发了一种新方法,其能通过向每个细胞中添加独特的DNA序列组合或索引来对单一细胞大量的甲基化组进行特性分析;研究人员利用这种新型索引技术对多个人类细胞系和小鼠大脑细胞进行研究后揭示出了3282个单一细胞的甲基化组(methylome),在通量方面,其要比当前单细胞测序的方法高出将近40倍。



  最后研究者Adey说道,我们能够对成千上万个细胞同时进行分析,这项新技术还能够降低我们制备单细胞DNA甲基化文库的成本,其能将成本从每个细胞20-50美元降低到50美分。


文章信息:Highly scalable generation ofDNA methylation profiles insingle cells, Nature Biotechnology (2018), DOI:10.1038/nbt.4112.


本文转自:生物谷

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