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佳能5D3对焦系统共有61个自动对焦点，相机提供了6种自动对焦区域模式：
1、定点自动对焦。
2、单点自动对焦。
3、单点十字扩展自动对焦。
4、单点周围扩展自动对焦。
5、9点区域自动对焦。
6、61点全区域自动对焦。
区域模式的意思就是选定的对焦点可以在多大的范围内对被摄物体进行自动对焦，是相对固定的一点还是一个区域（比如“十字”自动对焦点扩展有5个对焦点，这些对焦点覆盖的就是一小片区域）。单点对焦：就是以一个点对焦；其余都属于动态区域对焦。每种对焦模式对焦区域的范围都不同，从小到大依次排列，最小为单点对焦，最多为61点对焦。在上述六种对焦模式中，没有哪一种是十全十美的最佳模式，上述的6种对焦模式大致可以分为三组，第一组为单点对焦（包括定点）；第二组为单点扩展；第三组为区域对焦。
第一组为单点及定点对焦模式，二者都是单点对焦模式，只不过定点对焦模式对焦点的范围更加细小，被摄主体前还有其他干扰物情况下，例如隔着栅栏拍摄物体，可以减少误对焦到栅栏上，同时由于是小面积对焦，精度更好些，定点对焦有人误认为是中心点对焦这是不对的。在拍摄人像时，就可以使用定点自动对焦模式对模特眼部准确对焦，微距摄影也常用定点对焦。但是由于对焦范围过小，手持时稍微有点晃动或拍摄移动的主体都可能难以合焦。
第二组为单点对焦的扩展版，二者都合适于拍摄运动激烈的被摄体，捕捉移动速度快、易偏离自动对焦点的被摄体。
扩展自动对焦区域（周围）有8个辅助对焦点；自动对焦点扩展（上下左右即十字扩展）4个辅助对焦点。在移动主体的移动速度和范围小时，用“十字扩展”；在移动主体的移动速度和范围大时，用“周围扩展”，可能在对焦的精确度上会更好些。
这两种扩展对焦模式并不是最近对焦点优先合焦，它是以中央对焦点合焦，周围扩展的点是用来辅助中央对焦点对焦的。自动对焦点扩展比使用区域自动对焦更容易对目标主体对焦。二者还具备以下特点：
1、（拍摄静止被摄体）使用单次自动对焦驱动模式时，当扩展自动对焦点合焦时，还会与手动选择的自动对焦点（中心点）一起显示扩展自动对焦点。
2、（拍摄运动被摄体）使用人工伺服自动对焦驱动模式时，手动选择的自动对焦点（中心点）必须首先对主体进行追踪对焦。但是，这要比使用区域自动对焦更容易对目标主体对焦。
第三组为区域自动对焦，一种为全区域，一种为把全区域61个自动对焦点分为9个区域。该组模式对选定区域中的所有自动对焦点都用于对焦点的自动选择，所以该组模式是对最近的主体对焦。该组模式虽然对拍摄移动的被摄体合焦比较容易，但对指定目标的对焦却较为困难。
9点区域自动对焦适合于拍摄前就预先构好图的；也合适于被摄体本身或对被摄体准备合焦的部分比较大时使用，可简便又恰当地捕捉被摄体。
61点自动对焦合适于：1、在某些条件下，可能无法追踪拍摄主体。（如拍摄天空中的飞鸟，因主体太小而且在移动）；2、难以捕捉不规则运动的被摄体时（比如花样滑冰的跳跃等）有效。
61点自动对焦可以说是退而求其次，这至少比完全不能合焦好。
1、(拍摄静止被摄体)当与单次自动对焦模式配合时，半按下快门按钮会显示合焦的自动对焦点，如果显示多个自动对焦点意味着这些自动对焦点全部合焦。如对集体照之类的效果不错。
2、（拍摄静止转换为运动被摄体）当与人工智能自动对焦模式配合时，在单次自动对焦模式下对主体对焦后，如果主体开始移动，相机在检测移动并自动将自动对焦模式变更为人工智能伺服自动对焦，只要该主体被区域自动对焦框覆盖，相机便会持续进行跟踪对焦。
3、（拍摄运动被摄体)当与人工智能伺服自动对焦模式配合时，首先使用手动选择的自动对焦点进行对焦，自动对焦过程中，如果拍摄主体离开手动选择的自动对焦点，只要该主体被区域自动对焦框覆盖，相机便会持续进行跟踪对焦。（注：开始拍摄前，要考虑好被摄体在场景中的构图位置，选好拍摄方向，选好对焦点放在被摄主体位置）
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