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国家蛋白质科学基础设施—北京基地项目简介
国家蛋白质科学基础设施-北京基地（凤凰工程），是国务院“十一五”期间批准设立的12个重大科技基础设施之一，是迄今我国生命科学领域第一个国家级大科学工程。项目于2008年11月经国家发改委批准立项，由国家发改委、总后勤部、教育部和北京市政府共同投资，统一部署，集中建设，是我国开展大规模蛋白质科学研究与产品开发的核心基地，是我国抢占世界生命科学研究战略前沿的重要基础。
军事医学科学院为凤凰工程的法人单位，清华大学、北京大学和中科院生物物理研究所为共建单位，项目总投资12.22亿元，建设周期3.5年。凤凰工程采用“一体两翼”的建设方案，由军事医学科学院负责在中关村生命科学园建设总部和主体设施（一体），以蛋白质组研究为核心，集成功能分析系统和辅助支撑系统；清华大学和北京大学在各自校内建设辅助设施（两翼），其中清华大学以电镜为主，北京大学以核磁为主；同时吸纳中科院生物物理所现有蛋白质相关研究设施。
凤凰工程作为国家集中有限资源重点投资建设的研究平台，本着突出重点、前瞻部署、精确实施的原则进行建设。根据《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006-2020）》中重大科学研究计划要求，把握世界科学发展趋势，立足我国蛋白质目前的研究水平和研究基础，围绕蛋白质科学研究三个层次来设计，即以国家蛋白质科学基础设施和其分属的系统：蛋白质组分析系统、功能蛋白质组研究系统、结构蛋白质组解析系统、蛋白质组研究核心支撑系统以及各种分系统共三个层次。在具体的工程实施上细分为“系统－分系统（子系统）－工作线（功能模块）－设备”。
根据国家发改委批复，工程建设完成后，组建国家蛋白质科学中心（北京）。
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