所有TCGA视频课程百度云链接（附原网址链接）

    肿瘤基因组图谱 (TCGA) 计划由美国 National Cancer Institute(NCI) 和National Human Genome Research Institute（NHGRI）于 2006 年联合启动的项目。

1. 从癌症方面说，目前共计研究涉及到 36 种癌症类型。主要包括ACC、BLCA、BRCA、CESC、CHOL、COAD、DLBC、ESCA、GBM、HNSC、KICH、KIRC、KIRP、LAML、LGG、LIHC、LUAD、LUSC、MESO、OV、PAAD、PCPG、PRAD、READ、SARC、SKCM、STAD、TGCT、THCA、THYM、UCEC、UCS、UVM&oq=ACC、BLCA、BRCA、CESC、CHOL、COAD、DLBC、ESCA、GBM、HNSC、KICH、KIRC、KIRP、LAML、LGG、LIHC、LUAD、LUSC、MESO、OV、PAAD、PCPG、PRAD、READ、SARC、SKCM、STAD、TGCT、THCA、THYM、UCEC、UCS、UVM等。

2. 从TCGA数据类型来说，TCGA中数据类型主要有SNV（单核苷酸变异）数据、RNA-seq数据、CNV（基因拷贝数变异）数据、甲基化数据、临床数据、miRNA-seq数据，以及生物样本数据。每个数据类型都有相应的测量工具：

 2.1 用于SNV数据的工具有：SomaticSniper、MuSE Variant、VarSan2 和MuTect2。

 2.2 用于RNA-seq的工具有：HTSeq-Counts、HTSeq-FPKM以及HTSeq-FPKM-UQ。

 2.3  用于甲基化测序数据的工具有：MethyArray 27K和450K数据%3B。

2.4  用于miRNA-seq数据的工具：BCGSC。

今日视频福利

     有些同学说我们的视频课程稍微有点模糊，没关系，我们现已准备搜集全部高清视频，所以过几天的样子，我们会把原始高清的视频发于每一个已经购买过视频课程的同学（任何买过视频的同学，我们都有登记）。下面为了方便大家的学习系统性学习的TCGA，给大家找到了TCGA视频教学系统性全部课程(分为原百度云链接和某些机构上传的原始网页网址两部分。所以绝对高清，我们只是把网址和百度云汇集在一起)，多说一句，我们不是卖视频，不是卖视频，所有视频都是免费，卖的是自己的归纳总结，卖的是自己的勤劳。同学们也可以自己花时间去找，去归纳总结。想从我们这里获取归纳总结的网址链接的同学可以继续往下看，有了这一系列归纳性的学习，还怕发不了SCI文章？什么？不存在的。具体内容如下：

第一部分：

TCGA百度云链接

第二部分：

在线系统性学习TCGA。

第一步：我们首先认识TCGA和部分操作：

①TCGA数据库的认识

②TCGA数据手把手教你下载数据

③TCGA手把手教你命令行下载数据

第二步：我们了解TCGA后，我们该学习具体实际操作了，该部分视频包括了入门、甲基化分析、科研数据、临床数据的下载：

①某机构教你零基础入门TCGA

②TCGA数据库的甲基化分析（此视频英文授课）

③TCGA数据库相关临床数据下载及提取课程

第三步：我们操作了入门、甲基化分析、科研数据、临床数据的下载之后，我们继续来做具体的工具分析及挖掘：

①cBioPortal网站分析TCGA数据库的癌症基因（126个肿瘤基因组，两万八千例标本）：

②挖掘TCGA数据后进行泛肿瘤分析

③TCGA范癌症分型（英文）

第四步：我们都学会了TCGA，那么我们到底怎么绘图？怎么写文章？

①通过挖掘别人的TCGA数据发SCI文章（1小时课程）

②R语言 TCGA：根据AJCC分期绘制基因表达箱线图

③TCGA-PRAD(RNA-Seq）：（英文）

④TCGA PRAD, RNA-Seq ＆ DNA Methylation Integration：（英文）网速慢，不截图了。

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都是价值上千的直播课程

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