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十八般武艺之Pubmed大变脸

 解螺旋 2020-08-27

作者:will

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但凡学过文献检索的人都熟悉Pubmed,官方的Pubmed有着鲜明的特色,特别是检索式的定制上,配合布尔逻辑运算符,可以最大程度的进行私人订制。

然而,Pubmed在最终的检索结果界面,却不如人意,无法进行文献分析,只是单纯的将所有的检索结果罗列在一起,没有优劣之分。

根据80/20法则:世界上20%的人拥有80%的财富,也可以发现,20%的学术文献掌握者整个学术发展的命脉。那么,我们该如何对文献进行评判?如何筛选出这20%的文献呢?

基于如何对Pubmed网站内容进行文献分析这个问题,很多机构对pubmed数据库进行二次定制,从而诞生了很多不同的网站(数据来源于Pubmed),用于文献分析,本文主要介绍了4大文献检索、分析网站:GoPubmed、PubReminer、GeenMedical、Pubmedplus。

GoPubmed

网站:http://www./web/gopubmed/

这是我第一次接触pubmed定制的网站,当时刚刚开启检索数据库的大门,对很多检索知识还知之甚少。每一次检索pubmed官网的时候,都能检索出成百上千篇文献,可是,面对如此繁杂的文献,却不知从何下手,不知道该先阅读哪些文献。偶然一次机遇,让我遇见了Gopubmed,好像在断桥遇见白娘子,好生喜爱。

不过,GoPubmed也有不足的地方,每一次检索,只能检索出10万篇文献量。但是,一般我们如果对某一研究方向进行检索,精炼检索式,不会检索出10万篇文献。

Gopubmed,主要是用于文献分析的,特别是网站上有一条分类“high impact journals”(以下缩写为HIJ),可以一下在检索出高影响力的文献,立马将文献阅读范围缩小至10-20%,可以首先阅读HIJ的文献。 

 

当然,GoPubmed的核心还可以对所有文献进行分析,网站上有一个“Statistics”选项,单击后可以对检索的文献进行分析排序,比如按”年代、国家、地区、期刊“,从中,可以看出你研究方向的整个发展历史。 

 

在"Statistics"分析的最后,还会自动生成一张全球文献分布图,可以简单明了地看到,你研究的方向,在哪些国家地区研究的多,哪些国家地区研究的少。 

PubReminer

网站:http://hgserver2./cgi-bin/miner/miner2.cgi

PubReminer一次最多检索出25000篇文献,相较于GoPubmed更少,而且,在二次分析时同样也有”年代、作者、期刊“这几大类,但是,其独有的”Word、Mesh、Substances“却另有一番韵味,可以与GoPubmed相辅相成。

GreenMedical

网站:http://www./

GreenMedical和Pubmedplus是近几年刚刚发展起来的,检索时也非常的方便。能够通过影响因子对检索的文献进行二次分析,检索的结果,也能导出题录,并且能够免费下载大部分文献。

文献下载的内核基于SCI-HUB(对于Sci-Hub这里就不介绍了大家可以自行百度),所以,文献下载的量已经非常大了,可以满足日常文献下载阅读需求。

Pubmedplus

网站:http:///#/index

Pubmedplus,相较于GreenMedical,虽不能对检索的文献进行二次影响因子分析,但是,在每一篇文献下方,都显示了文献的影响因子,因此,可以和GreenMedical互补,当然,对于大部分文献也是可以进行免费下载的,内核也是基于Sci-Hub的。 

总结

以上介绍了基于pubmed数据库的几大检索网站,可以方便大家日常的检索,也方便大家论文的下载。不过,做研究,最重要的是要阅读文献,这一系列检索方法,都是为最终的文献阅读做铺垫,所以,还是希望大家平时多多阅读,才能提高自己的文献修养。

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