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微头条

 stingray928 2018-07-04
【合成基因领域巨头Ginkgo Bioworks利用机器学习算法寻找有害的DNA序列】

目前世界上的基因合成公司都会对客户的DNA获取请求进行筛选,以免不法分子购买危险病毒,细菌和毒素的DNA序列。然而阿尔伯塔大学的研究人员,在开发新型疫苗的过程中,通过订购的DNA片断成功构建了已经灭绝的马痘病毒,一种天花病毒的近亲。这引发了生物安全和防御领域从业者对现有筛选系统的质疑。

据IEEE报道,为了减少这种潜在威胁,美国政府上周与合成基因领域巨头Ginkgo Bioworks签署了6400万美元合同,后者将为新生的合成生物学行业开发一系列生物安全产品,其中包括改进基因合成公司筛选订单的算法,以及利用机器学习模型检测DNA样本是否被动过手脚。

Ginkgo设计主管Patrick Boyle表示,该公司过去十年中已经开发了识别有益DNA序列的算法,并用来生成微生物,以帮助创造新型香料和肥料。现在公司将调整这些算法和模型,来预测DNA序列是否有害。Ginkgo计划利用DNA序列数据库训练深度学习模型,以尝试识别人们无意识地包含在DNA序列设计中的“工程签名”。(图片来源:Ginkgo Bioworks)

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