生信草堂 在高通量测序文章中,作者一般都会将原始数据上传到NCBI中,供后续研究者验证和参考。 而我们在文章中,可以获得的往往只有编号,例如: 那么该怎么来批量下载文章中的所有或某几个样本的数据呢? 1 打开NCBI数据库(https://www.ncbi.nlm./),在搜索框输入要查询的编号。 2 3 4 运行命令:prefetch --option-file SraAccList.txt下载完成后,文件被存储在默认目录:/home/usrname/ncbi/public/sra/ 以上就是下载NCBI-SRA的测序原始数据的方法, 欢迎小伙伴们留言讨论。 |
|
来自: 风雨都停了 > 《NCBI SRA原始数据下载》