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与细菌相爱相杀多年,却忽视了一直陪伴我们的那个“她”

 明醫 2018-08-15

但是,微生物组这个大家庭里可不仅仅只有细菌哦。越来越多的研究人员认为,除了细菌,栖息在我们体内的真菌对人体健康的影响也是不容忽视的。



美国凯斯西储大学的医学真菌学家Mahmoud Ghannoum最先创造了mycobiome一词。“2008年,我参加一个会议时注意到人们已经开始谈论微生物组,”他回忆说,“但是大多数情况下他们只谈论细菌,忽视了真菌和病毒,而这些微生物也是人体微生物组的重要组成部分”。



真菌何以如此重要呢?

一起去参观一下真菌的世界吧


口腔真菌

2010年,Ghannoum研究团队在《PLoS Pathogens》上发表了一篇文章,首次使用基因测序技术来研究人类口腔中真菌的组成。通过建立健康人的真菌基线,从而研究病人口腔中的真菌变化情况。虽然之前有研究报告称我们口腔中的真菌种类和数量都非常有限,主要是念珠菌Candida,当其过度生长时会导致鹅口疮。Ghannoum和他的同事研究了20名参与者的口腔,却发现了一个名副其实的真菌的国度。



研究中总共发现了101种真菌,每个人口腔中都有9到23株,包括最常见的各种念珠菌。这个核心真菌群落不仅包括一些潜在的有益菌,如布拉酵母菌Saccharomyces boulardii,还包括一些致病菌,如枝孢属Cladosporium、金担子菌属Aureobasidium等。


而后,一些研究者在健康人的口腔中也相继发现了一些最常见的致病真菌,如曲霉菌Aspergillus,镰刀菌Fusarium,隐球菌Cryptococcus。Ghannoum认为,如此多的潜在致病真菌存在于健康口腔中可能意味着,在正常情况下,其他真菌和细菌可以抑制这些致病真菌的繁殖,维持口腔健康。


几年后,Ghannoum发表了一篇文章,通过研究HIV感染者口腔中的真菌发现真菌失衡可以导致疾病。此外还发现,毕赤酵母Pichia (一种农业上用于防止其他真菌在各种作物上生长的酵母)可以抑制念珠菌和其他病原真菌的生长。


“通过在实验室中培养毕赤酵母,我们发现它可以分泌一种能治疗动物真菌感染的化合物,”Ghannoum说。在免疫系统受损的小鼠中接种毕赤酵母后发现,小鼠在接种念珠菌时发生的感染要比没有接种毕赤酵母的小鼠轻得多。


肠道真菌

加州大学洛杉矶分校的David Underhill教授也是一位研究真菌的科学家。2012年Underhill和他的同事在《Science》上发表了一篇文章,同样是利用测序方法分析了小鼠肠道真菌群落。研究发现,每个小鼠的肠道中平均有50到60个真菌属,并且每个属中都包含有很多个种。


“我们发现小鼠肠道中的真菌多样性非常惊人,”Underhill说,“但我们也对这些真菌是如何导致疾病的很感兴趣。”


在同一项研究中,Underhill研究团队发现哺乳动物肠道中的真菌与免疫系统互作可以控制肠道炎症的发生。他们在免疫细胞表面发现了一种叫做树突状细胞相关性C型植物血凝素(Dectin-1)的蛋白质,它可以帮助我们的身体识别和去除病原真菌。当编码Dectin-1的基因被抑制后,会诱导小鼠产生更加严重的结肠炎。随后,他们发现了一个Dectin-1基因突变体,预测了一种称为溃疡性结肠炎的严重炎症性肠病。


Underhill认为,肠道真菌群落的改变可能是导致炎症性肠病的一个重要原因,并且可能作为一个潜在的治疗靶点。当然,他也承认,炎症性肠病的诱因很多,真菌只是其中一个方面,还有许多其他的因素。


其它真菌

许多其他研究者也对真菌做了大量的研究。在2012年和2013年,一个日本团队和国立卫生研究院的研究人员分析了皮肤上的真菌,发现不同部位的真菌群落存在差异,这些发现可能有助于寻找新的真菌性皮肤病的治疗方法。


最近,法国研究人员发现健康人肺中存在的真菌与囊胞性纤维症患者肺中的真菌具有显著差异。曲霉菌在健康人的肺部最为普遍,而念珠菌在囊胞性纤维症和其他肺病患者中占优势。


微生物组是一个整体

细菌、病毒、真菌以及遗传因素等都会影响人体的健康。“我们知道,有些人服用抗生素后会发生真菌感染,”Ghannoum说,“显然,这些微生物群落之间存在着相互作用的关系。在我看来,不能把细菌或真菌单拎出来,你必须把它们当做一个整体,而且我确信病毒也发挥着一定的作用。我们应该要从整体上看待问题”。


Ghannom实验室最近一项研究发现,肠道中的真菌和细菌互作可以恶化克罗恩病患者的自身免疫反应。


益生菌疗法新方向


粪菌移植移的可不只是细菌哦!

将健康供体的肠道菌群移植到艰难梭菌结肠炎患者体内,病人好转的几率非常高。而越来越多的证据表明,同时包含有细菌和真菌的益生菌疗法可能会对疾病的治疗更有益处。


然而,正如纽约大学微生物组研究员Jose Scher博士所言,益生菌研究,特别是真菌领域,还处于初期阶段。但是,Scher对此仍然充满希望。“一切才刚刚开始,”他说,“我认为明确细菌、病毒和真菌的互作机理将有助于我们开发更有效的疗法。”


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