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看完这篇图解 PCA,面试再也不担心

 手写的从前2016 2018-09-13

作为经典降维方法,PCA(Principal components analysis)是机器/算法学习工程师及数据分析师面试时 99% 可能会问到的问题。由于缺乏对 PCA 的物理和几何意义的深入理解,此题也成为一道颇有难度的问题。本文旨在通过形象化的表达和数学推导带你深入理解PCA。


为什么要 PCA

PCA 是为了降低特征的维度。在实际工作中,可能会遇到特征维数过多,且部分特征具有一定相关性。如:在一个学生成绩数据集中,一个特征是学习时长,另一个特征是成绩,一般来讲,学习时间越长,越容易取得好成绩,即时长与成绩呈正相关。因此没必要用两个维度(时长和成绩)表达这一特征。我们可以找出另一个维度,表现这两个特征,且不会带来过多信息损失。

由图可知,可以用数据点在 Z 轴上的投影表达时长与成绩两个维度的数据。一个平面上的数据就被映射到了一条线当中,即二维特征向一维特征的转换。


如何 PCA

为了让高维度特征向低维度特征的映射更加精确,在上例中,我们需要找出一条使得所有的实例(entity)到坐标轴垂直距离(图中虚线部分)最短的一条坐标轴 Z。同时这条坐标轴也满足数据在其上散布最广。

在数学中,我们用方差定义数据的离散程度,公式如下:



其中 m 表示 entity 的总数,即 m 个实例,a(i) 是第 i 个实例的属性 a, μ 表示该属性在所有实例当中的均值(mean)。再来看看我们一会儿要用到的另一个公式:协方差公式,表示两个向量之间的相关性:



有些教材中会把 m 写成 m-1,请忽略,实际没有本质区别。

在上面两个公式中,均值被反复用到,由于进行矩阵运算时,减去均值的操作不方便,我们可以提前让所有的特征减去其均值,即 a(i) := a(i) - μ(a)。这个操作叫做 mean normalization。因此方差公式和协方差公式就可以被简化成:




这在将来做矩阵运算时很有帮助。

回到问题,我们想找出指定的 K 个维度,使数据在这 K 个维度上损失最少 -> 散布最广 。除了用方差衡量我们要取的坐标轴外,还应考虑数据在新维度上的散布不具有任何相关性,回到最开头的问题,在原始数据中,两个属性(学习时长和成绩)具有相关性,我们希望降维来去除这种相关性,这也是 PCA 的意义之一。

回顾上面的公式,协方差表示了向量间的相关性,协方差为 0,向量完全不相关,向量互相正交。

问题被转化成了,我们希望找出一组基向量(需要是标准正交基),数据在这组基向量构成的空间中表示时,任何两个属性间相关性为零。我们取出数据散布最广的前 K 个维度,就是我们希望求取的新坐标系(基向量),将原本的数据以新的基向量为参考系表示出来,就是数据压缩后的结果。

假设 A 是原始数据集,每一行代表一个文档,每一列代表指定单词在文档中出现的次数。

计算一下 A 的转置与 A 相乘。



把矩阵的每一项除以 entity 的个数 m,你会发现,这是一个实对称矩阵,对角线上的值是其方差(红圈部分),其他值对应两个属性之间的协方差(以黄色下划线部分为例)。我们希望找出一个新的基向量所代表的空间 P(每列是一个基向量),原始的数据 A 在 P 的衡量下的新的表示方式为 Z,即 Z = AP,如果 (1/m)*Z(T)Z 能变成一个对角矩阵(除对角线外其余元素为 0),那么 P 就是我们想找的那组基向量。

在数学中一个实对称矩阵有 3 个性质:

  1. 不同特征值对应的特征向量必然正交

  2. k 重特征值必定对应 k 个线性无关的特征向量


左侧公式展开了 Z 的协方差矩阵,右侧公式是矩阵的特征值/奇异值分解。可以发现特征值分解后,特征向量所组成的矩阵正好是一个对角矩阵,因此特征值分解原数据矩阵 A 后,特征向量所组成的矩阵即为要求的矩阵 P。

我们已经求出了新的空间 P,那么如何选取 P 最重要的 N 个维度,去除其他维度,以进行降维呢?

根据上面的推导,我们认为 Σ 和 Z 的协方差矩阵 (1/m)*Z(T)Z 相等,就是说,Σ 上对角线的值就是 Z 的每个属性的方差,由此我们可以确定,如果将 Σ 对角线上的元素按降序排列,取出 U 的前 K 个值,那么降维就完成了。



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