生信分析平台搭建（五）：个性化设置

九：个性化设置

1、安装vim

系统自带的vi不好用，不支持语法高亮，还是使用vim方便。切换到root账户，利用apt下载vim

apt install -y vim

2、cd /usr/bin目录下，将原来vi命令修改为vi.bak，直接删除也可以，然后将vim命令链接为vi，这样以后系统中使用vi命令，默认是使用vim。

3、配置vim，利用vim打开 /etc/vim/vimrc文件，删除原有内容，将下面这些内容添加进去，保存退出。这些是用来设置vim特性的，我使用的比较简单，主要就是语法高亮以及设置行号，其实还有非常多个性化的设置。Linux系统命令行软件没有图形化设置菜单，很多东西都是通过文本的配置文件进行设置。要熟悉这种方式。

4、再次打开文件，发现多了行号，文本颜色也发生了变化，表明设置成功了。

5、修改系统源

源是系统默认下载资源的网站，比如前面我们apt命令下载vim，默认从 http://cn.archive./ubuntu/ 这个站点进行下载，可以切换到国内站点，这样速度会明显提升。有时需要添加一些额外站点，这样才能下载到需要的资源。比如修改为国内的阿里云的站点。

6、cd /etc/apt目录下，使用的就是sources.list文件，首先备份一下，cp sources.list sources.list.bak

然后利用vim 修改sources.list，从网上找到新的源网址，复制进去，保存退出，apt update更新一下。

7、默认的命令行界面是白色或者绿色，不是很明显，Linux的好处就是什么都可以修改。每个用户home目录下的.bashrc 文件中的PS1变量用来控制命令行显示。

8、vim打开.bashrc文件，找到其中的PS1，将其替换为下面代码。不同系统.bashrc文件少有差别，有些还包括PS2，这个是子shell，一般不怎么用。

PS1="\[\033]2;\h:\u \w\007\033[33;1m\]\u \033[35;1m\t\033[0m \[\033[36;1m\]\w\[\033[0m\]\n\[\e[32;1m\]$ \[\e[0m\]"

9、source .bashrc刷新一下，或者新开一个Terminal即可看到变化。这样是不是好了很多，可以自己设置更多的模式。

10、可以通过Edit菜单进行更多个性化设置，例如修改主题颜色，透明度等，可以在透明界面播放NBA，上面敲代码。

11、alias常用命令，可以将一些常用的复杂命令通过alias添加到.bashrc中，例如ll='ls -lh --file-type' ，我一般喜欢用单个字母表示，例如t=top，e=exit，d=display，可以根据个人偏好进行设置。

12、修改PATH，.bashrc中的PATH变量非常重要，这个系统默认搜索程序路径，别人系统直接敲bwa可以，你的不行，即使你安装了软件，这是因为bwa可执行的程序没有添加到PATH变量中。一般我喜欢将一个点“.”添加进去，这样省去敲"~/."来运行程序。

Tips:以上所有操作都是用root账户完成，使用root账户需要小心。